Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEW7

TMIE, Transmembrane inner ear expressed protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIEQ8NEW7 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMIEQ8NEW7 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
TMIEQ8NEW7 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMIEQ8NEW7 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMIEQ8NEW7 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMIEQ8NEW7 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMIEQ8NEW7 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMIEQ8NEW7 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMIEQ8NEW7 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMIEQ8NEW7 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMIEQ8NEW7 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMIEQ8NEW7 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMIEQ8NEW7 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMIEQ8NEW7 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMIEQ8NEW7 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
TMIEQ8NEW7 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMIEQ8NEW7 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMIEQ8NEW7 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMIEQ8NEW7 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMIEQ8NEW7 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMIEQ8NEW7 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMIEQ8NEW7 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMIEQ8NEW7 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMIEQ8NEW7 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TMIEQ8NEW7 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TMIEQ8NEW7 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TMIEQ8NEW7 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TMIEQ8NEW7 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TMIEQ8NEW7 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TMIEQ8NEW7 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TMIEQ8NEW7 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TMIEQ8NEW7 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TMIEQ8NEW7 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TMIEQ8NEW7 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TMIEQ8NEW7 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TMIEQ8NEW7 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TMIEQ8NEW7 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TMIEQ8NEW7 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TMIEQ8NEW7 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
TMIEQ8NEW7 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
TMIEQ8NEW7 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TMIEQ8NEW7 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TMIEQ8NEW7 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TMIEQ8NEW7 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
TMIEQ8NEW7 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TMIEQ8NEW7 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
TMIEQ8NEW7 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
TMIEQ8NEW7 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TMIEQ8NEW7 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TMIEQ8NEW7 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TMIEQ8NEW7 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TMIEQ8NEW7 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TMIEQ8NEW7 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TMIEQ8NEW7 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
TMIEQ8NEW7 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TMIEQ8NEW7 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TMIEQ8NEW7 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TMIEQ8NEW7 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TMIEQ8NEW7 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TMIEQ8NEW7 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TMIEQ8NEW7 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TMIEQ8NEW7 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TMIEQ8NEW7 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
TMIEQ8NEW7 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
TMIEQ8NEW7 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
TMIEQ8NEW7 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TMIEQ8NEW7 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TMIEQ8NEW7 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TMIEQ8NEW7 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
TMIEQ8NEW7 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
TMIEQ8NEW7 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TMIEQ8NEW7 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TMIEQ8NEW7 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TMIEQ8NEW7 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TMIEQ8NEW7 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TMIEQ8NEW7 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TMIEQ8NEW7 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TMIEQ8NEW7 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TMIEQ8NEW7 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TMIEQ8NEW7 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TMIEQ8NEW7 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
TMIEQ8NEW7 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TMIEQ8NEW7 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TMIEQ8NEW7 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TMIEQ8NEW7 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TMIEQ8NEW7 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
TMIEQ8NEW7 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TMIEQ8NEW7 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TMIEQ8NEW7 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TMIEQ8NEW7 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TMIEQ8NEW7 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TMIEQ8NEW7 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TMIEQ8NEW7 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TMIEQ8NEW7 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
TMIEQ8NEW7 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TMIEQ8NEW7 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TMIEQ8NEW7 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TMIEQ8NEW7 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TMIEQ8NEW7 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TMIEQ8NEW7 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms