Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBF2

NHLRC2, NHL repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLRC2Q8NBF2 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NHLRC2Q8NBF2 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NHLRC2Q8NBF2 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NHLRC2Q8NBF2 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NHLRC2Q8NBF2 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NHLRC2Q8NBF2 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NHLRC2Q8NBF2 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NHLRC2Q8NBF2 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NHLRC2Q8NBF2 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NHLRC2Q8NBF2 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NHLRC2Q8NBF2 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NHLRC2Q8NBF2 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NHLRC2Q8NBF2 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NHLRC2Q8NBF2 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NHLRC2Q8NBF2 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NHLRC2Q8NBF2 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NHLRC2Q8NBF2 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NHLRC2Q8NBF2 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NHLRC2Q8NBF2 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NHLRC2Q8NBF2 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NHLRC2Q8NBF2 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NHLRC2Q8NBF2 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NHLRC2Q8NBF2 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NHLRC2Q8NBF2 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NHLRC2Q8NBF2 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NHLRC2Q8NBF2 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NHLRC2Q8NBF2 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NHLRC2Q8NBF2 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NHLRC2Q8NBF2 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NHLRC2Q8NBF2 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NHLRC2Q8NBF2 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NHLRC2Q8NBF2 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NHLRC2Q8NBF2 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NHLRC2Q8NBF2 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NHLRC2Q8NBF2 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NHLRC2Q8NBF2 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NHLRC2Q8NBF2 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NHLRC2Q8NBF2 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NHLRC2Q8NBF2 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NHLRC2Q8NBF2 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NHLRC2Q8NBF2 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NHLRC2Q8NBF2 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NHLRC2Q8NBF2 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NHLRC2Q8NBF2 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NHLRC2Q8NBF2 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NHLRC2Q8NBF2 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NHLRC2Q8NBF2 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NHLRC2Q8NBF2 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NHLRC2Q8NBF2 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NHLRC2Q8NBF2 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NHLRC2Q8NBF2 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NHLRC2Q8NBF2 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NHLRC2Q8NBF2 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NHLRC2Q8NBF2 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NHLRC2Q8NBF2 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NHLRC2Q8NBF2 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NHLRC2Q8NBF2 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NHLRC2Q8NBF2 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NHLRC2Q8NBF2 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NHLRC2Q8NBF2 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NHLRC2Q8NBF2 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NHLRC2Q8NBF2 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NHLRC2Q8NBF2 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NHLRC2Q8NBF2 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NHLRC2Q8NBF2 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NHLRC2Q8NBF2 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NHLRC2Q8NBF2 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NHLRC2Q8NBF2 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NHLRC2Q8NBF2 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NHLRC2Q8NBF2 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NHLRC2Q8NBF2 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NHLRC2Q8NBF2 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NHLRC2Q8NBF2 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NHLRC2Q8NBF2 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NHLRC2Q8NBF2 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NHLRC2Q8NBF2 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NHLRC2Q8NBF2 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NHLRC2Q8NBF2 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NHLRC2Q8NBF2 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NHLRC2Q8NBF2 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NHLRC2Q8NBF2 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NHLRC2Q8NBF2 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NHLRC2Q8NBF2 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NHLRC2Q8NBF2 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NHLRC2Q8NBF2 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NHLRC2Q8NBF2 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NHLRC2Q8NBF2 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NHLRC2Q8NBF2 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NHLRC2Q8NBF2 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NHLRC2Q8NBF2 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NHLRC2Q8NBF2 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NHLRC2Q8NBF2 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NHLRC2Q8NBF2 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NHLRC2Q8NBF2 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NHLRC2Q8NBF2 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NHLRC2Q8NBF2 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NHLRC2Q8NBF2 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NHLRC2Q8NBF2 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NHLRC2Q8NBF2 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NHLRC2Q8NBF2 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms