Protein–RNA interactions for Protein: Q8NB14

USP38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, humanhuman

Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP38Q8NB14 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP38Q8NB14 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP38Q8NB14 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP38Q8NB14 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP38Q8NB14 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP38Q8NB14 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP38Q8NB14 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP38Q8NB14 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP38Q8NB14 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP38Q8NB14 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP38Q8NB14 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP38Q8NB14 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
USP38Q8NB14 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP38Q8NB14 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP38Q8NB14 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP38Q8NB14 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP38Q8NB14 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP38Q8NB14 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP38Q8NB14 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP38Q8NB14 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP38Q8NB14 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP38Q8NB14 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP38Q8NB14 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP38Q8NB14 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP38Q8NB14 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP38Q8NB14 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP38Q8NB14 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP38Q8NB14 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP38Q8NB14 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP38Q8NB14 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP38Q8NB14 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP38Q8NB14 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP38Q8NB14 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
USP38Q8NB14 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP38Q8NB14 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP38Q8NB14 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP38Q8NB14 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP38Q8NB14 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP38Q8NB14 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP38Q8NB14 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP38Q8NB14 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP38Q8NB14 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP38Q8NB14 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP38Q8NB14 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP38Q8NB14 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP38Q8NB14 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP38Q8NB14 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
USP38Q8NB14 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
USP38Q8NB14 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP38Q8NB14 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP38Q8NB14 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP38Q8NB14 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP38Q8NB14 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP38Q8NB14 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP38Q8NB14 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP38Q8NB14 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP38Q8NB14 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP38Q8NB14 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP38Q8NB14 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP38Q8NB14 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP38Q8NB14 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP38Q8NB14 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP38Q8NB14 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP38Q8NB14 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP38Q8NB14 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP38Q8NB14 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP38Q8NB14 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
USP38Q8NB14 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP38Q8NB14 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP38Q8NB14 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP38Q8NB14 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP38Q8NB14 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP38Q8NB14 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP38Q8NB14 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP38Q8NB14 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP38Q8NB14 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP38Q8NB14 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP38Q8NB14 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP38Q8NB14 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP38Q8NB14 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP38Q8NB14 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP38Q8NB14 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP38Q8NB14 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP38Q8NB14 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP38Q8NB14 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP38Q8NB14 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP38Q8NB14 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
USP38Q8NB14 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP38Q8NB14 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
USP38Q8NB14 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP38Q8NB14 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
USP38Q8NB14 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
USP38Q8NB14 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
USP38Q8NB14 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
USP38Q8NB14 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP38Q8NB14 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP38Q8NB14 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP38Q8NB14 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP38Q8NB14 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP38Q8NB14 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms