Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAT1

POMGNT2, Protein O-linked-mannose beta-1,4-N-acetylglucosaminyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POMGNT2Q8NAT1 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POMGNT2Q8NAT1 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POMGNT2Q8NAT1 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POMGNT2Q8NAT1 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POMGNT2Q8NAT1 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POMGNT2Q8NAT1 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POMGNT2Q8NAT1 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POMGNT2Q8NAT1 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POMGNT2Q8NAT1 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POMGNT2Q8NAT1 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POMGNT2Q8NAT1 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POMGNT2Q8NAT1 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POMGNT2Q8NAT1 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
POMGNT2Q8NAT1 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POMGNT2Q8NAT1 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POMGNT2Q8NAT1 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POMGNT2Q8NAT1 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POMGNT2Q8NAT1 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POMGNT2Q8NAT1 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POMGNT2Q8NAT1 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POMGNT2Q8NAT1 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POMGNT2Q8NAT1 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POMGNT2Q8NAT1 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POMGNT2Q8NAT1 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POMGNT2Q8NAT1 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POMGNT2Q8NAT1 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POMGNT2Q8NAT1 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POMGNT2Q8NAT1 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POMGNT2Q8NAT1 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POMGNT2Q8NAT1 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
POMGNT2Q8NAT1 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POMGNT2Q8NAT1 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POMGNT2Q8NAT1 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POMGNT2Q8NAT1 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POMGNT2Q8NAT1 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POMGNT2Q8NAT1 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
POMGNT2Q8NAT1 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
POMGNT2Q8NAT1 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POMGNT2Q8NAT1 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POMGNT2Q8NAT1 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POMGNT2Q8NAT1 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POMGNT2Q8NAT1 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POMGNT2Q8NAT1 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POMGNT2Q8NAT1 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POMGNT2Q8NAT1 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POMGNT2Q8NAT1 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POMGNT2Q8NAT1 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POMGNT2Q8NAT1 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POMGNT2Q8NAT1 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POMGNT2Q8NAT1 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POMGNT2Q8NAT1 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POMGNT2Q8NAT1 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POMGNT2Q8NAT1 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POMGNT2Q8NAT1 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POMGNT2Q8NAT1 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POMGNT2Q8NAT1 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POMGNT2Q8NAT1 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POMGNT2Q8NAT1 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POMGNT2Q8NAT1 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
POMGNT2Q8NAT1 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POMGNT2Q8NAT1 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
POMGNT2Q8NAT1 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POMGNT2Q8NAT1 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POMGNT2Q8NAT1 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POMGNT2Q8NAT1 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POMGNT2Q8NAT1 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POMGNT2Q8NAT1 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POMGNT2Q8NAT1 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POMGNT2Q8NAT1 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POMGNT2Q8NAT1 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POMGNT2Q8NAT1 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POMGNT2Q8NAT1 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POMGNT2Q8NAT1 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POMGNT2Q8NAT1 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POMGNT2Q8NAT1 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POMGNT2Q8NAT1 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
POMGNT2Q8NAT1 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
POMGNT2Q8NAT1 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
POMGNT2Q8NAT1 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
POMGNT2Q8NAT1 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POMGNT2Q8NAT1 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POMGNT2Q8NAT1 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POMGNT2Q8NAT1 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POMGNT2Q8NAT1 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POMGNT2Q8NAT1 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POMGNT2Q8NAT1 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POMGNT2Q8NAT1 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POMGNT2Q8NAT1 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POMGNT2Q8NAT1 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POMGNT2Q8NAT1 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POMGNT2Q8NAT1 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POMGNT2Q8NAT1 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POMGNT2Q8NAT1 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POMGNT2Q8NAT1 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POMGNT2Q8NAT1 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POMGNT2Q8NAT1 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POMGNT2Q8NAT1 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POMGNT2Q8NAT1 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POMGNT2Q8NAT1 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POMGNT2Q8NAT1 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms