Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

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Length 142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CHCHD4Q8N4Q1 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CHCHD4Q8N4Q1 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CHCHD4Q8N4Q1 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CHCHD4Q8N4Q1 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CHCHD4Q8N4Q1 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CHCHD4Q8N4Q1 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CHCHD4Q8N4Q1 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CHCHD4Q8N4Q1 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CHCHD4Q8N4Q1 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CHCHD4Q8N4Q1 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CHCHD4Q8N4Q1 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
CHCHD4Q8N4Q1 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
CHCHD4Q8N4Q1 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
CHCHD4Q8N4Q1 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CHCHD4Q8N4Q1 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CHCHD4Q8N4Q1 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CHCHD4Q8N4Q1 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CHCHD4Q8N4Q1 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CHCHD4Q8N4Q1 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CHCHD4Q8N4Q1 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CHCHD4Q8N4Q1 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CHCHD4Q8N4Q1 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CHCHD4Q8N4Q1 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CHCHD4Q8N4Q1 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CHCHD4Q8N4Q1 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CHCHD4Q8N4Q1 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CHCHD4Q8N4Q1 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CHCHD4Q8N4Q1 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CHCHD4Q8N4Q1 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CHCHD4Q8N4Q1 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CHCHD4Q8N4Q1 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CHCHD4Q8N4Q1 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CHCHD4Q8N4Q1 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CHCHD4Q8N4Q1 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CHCHD4Q8N4Q1 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CHCHD4Q8N4Q1 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CHCHD4Q8N4Q1 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CHCHD4Q8N4Q1 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CHCHD4Q8N4Q1 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CHCHD4Q8N4Q1 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
CHCHD4Q8N4Q1 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
CHCHD4Q8N4Q1 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
CHCHD4Q8N4Q1 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CHCHD4Q8N4Q1 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CHCHD4Q8N4Q1 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CHCHD4Q8N4Q1 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CHCHD4Q8N4Q1 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CHCHD4Q8N4Q1 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CHCHD4Q8N4Q1 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CHCHD4Q8N4Q1 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CHCHD4Q8N4Q1 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CHCHD4Q8N4Q1 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CHCHD4Q8N4Q1 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CHCHD4Q8N4Q1 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CHCHD4Q8N4Q1 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CHCHD4Q8N4Q1 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CHCHD4Q8N4Q1 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
CHCHD4Q8N4Q1 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CHCHD4Q8N4Q1 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CHCHD4Q8N4Q1 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CHCHD4Q8N4Q1 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
CHCHD4Q8N4Q1 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CHCHD4Q8N4Q1 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CHCHD4Q8N4Q1 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CHCHD4Q8N4Q1 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CHCHD4Q8N4Q1 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CHCHD4Q8N4Q1 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CHCHD4Q8N4Q1 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CHCHD4Q8N4Q1 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CHCHD4Q8N4Q1 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CHCHD4Q8N4Q1 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CHCHD4Q8N4Q1 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CHCHD4Q8N4Q1 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CHCHD4Q8N4Q1 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CHCHD4Q8N4Q1 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CHCHD4Q8N4Q1 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CHCHD4Q8N4Q1 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CHCHD4Q8N4Q1 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CHCHD4Q8N4Q1 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CHCHD4Q8N4Q1 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CHCHD4Q8N4Q1 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CHCHD4Q8N4Q1 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CHCHD4Q8N4Q1 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CHCHD4Q8N4Q1 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CHCHD4Q8N4Q1 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CHCHD4Q8N4Q1 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CHCHD4Q8N4Q1 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CHCHD4Q8N4Q1 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CHCHD4Q8N4Q1 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CHCHD4Q8N4Q1 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CHCHD4Q8N4Q1 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CHCHD4Q8N4Q1 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CHCHD4Q8N4Q1 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CHCHD4Q8N4Q1 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
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