Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z398

ZNF550, Zinc finger protein 550, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF550Q7Z398 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF550Q7Z398 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF550Q7Z398 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF550Q7Z398 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF550Q7Z398 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF550Q7Z398 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF550Q7Z398 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF550Q7Z398 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF550Q7Z398 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF550Q7Z398 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF550Q7Z398 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF550Q7Z398 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF550Q7Z398 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF550Q7Z398 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF550Q7Z398 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF550Q7Z398 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF550Q7Z398 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF550Q7Z398 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF550Q7Z398 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF550Q7Z398 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF550Q7Z398 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF550Q7Z398 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF550Q7Z398 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF550Q7Z398 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF550Q7Z398 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF550Q7Z398 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF550Q7Z398 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF550Q7Z398 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF550Q7Z398 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF550Q7Z398 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF550Q7Z398 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF550Q7Z398 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF550Q7Z398 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF550Q7Z398 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF550Q7Z398 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF550Q7Z398 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF550Q7Z398 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF550Q7Z398 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF550Q7Z398 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF550Q7Z398 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF550Q7Z398 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF550Q7Z398 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF550Q7Z398 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF550Q7Z398 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF550Q7Z398 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF550Q7Z398 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF550Q7Z398 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF550Q7Z398 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF550Q7Z398 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF550Q7Z398 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF550Q7Z398 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF550Q7Z398 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF550Q7Z398 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF550Q7Z398 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF550Q7Z398 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF550Q7Z398 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF550Q7Z398 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF550Q7Z398 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF550Q7Z398 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF550Q7Z398 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF550Q7Z398 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF550Q7Z398 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF550Q7Z398 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF550Q7Z398 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF550Q7Z398 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF550Q7Z398 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF550Q7Z398 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF550Q7Z398 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF550Q7Z398 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF550Q7Z398 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF550Q7Z398 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF550Q7Z398 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF550Q7Z398 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF550Q7Z398 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF550Q7Z398 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF550Q7Z398 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF550Q7Z398 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF550Q7Z398 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF550Q7Z398 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF550Q7Z398 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF550Q7Z398 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF550Q7Z398 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF550Q7Z398 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF550Q7Z398 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF550Q7Z398 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF550Q7Z398 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF550Q7Z398 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF550Q7Z398 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF550Q7Z398 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF550Q7Z398 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF550Q7Z398 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF550Q7Z398 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF550Q7Z398 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF550Q7Z398 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF550Q7Z398 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF550Q7Z398 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF550Q7Z398 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF550Q7Z398 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF550Q7Z398 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF550Q7Z398 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms