Protein–RNA interactions for Protein: Q7L099

RUFY3, Protein RUFY3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY3Q7L099 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RUFY3Q7L099 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RUFY3Q7L099 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RUFY3Q7L099 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RUFY3Q7L099 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RUFY3Q7L099 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RUFY3Q7L099 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RUFY3Q7L099 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RUFY3Q7L099 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RUFY3Q7L099 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RUFY3Q7L099 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RUFY3Q7L099 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RUFY3Q7L099 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RUFY3Q7L099 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RUFY3Q7L099 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RUFY3Q7L099 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RUFY3Q7L099 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RUFY3Q7L099 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RUFY3Q7L099 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RUFY3Q7L099 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RUFY3Q7L099 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RUFY3Q7L099 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RUFY3Q7L099 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RUFY3Q7L099 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RUFY3Q7L099 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RUFY3Q7L099 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RUFY3Q7L099 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RUFY3Q7L099 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RUFY3Q7L099 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RUFY3Q7L099 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RUFY3Q7L099 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RUFY3Q7L099 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RUFY3Q7L099 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RUFY3Q7L099 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RUFY3Q7L099 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RUFY3Q7L099 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RUFY3Q7L099 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RUFY3Q7L099 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RUFY3Q7L099 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RUFY3Q7L099 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RUFY3Q7L099 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RUFY3Q7L099 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RUFY3Q7L099 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RUFY3Q7L099 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RUFY3Q7L099 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RUFY3Q7L099 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RUFY3Q7L099 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RUFY3Q7L099 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RUFY3Q7L099 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RUFY3Q7L099 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RUFY3Q7L099 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RUFY3Q7L099 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RUFY3Q7L099 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RUFY3Q7L099 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RUFY3Q7L099 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RUFY3Q7L099 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RUFY3Q7L099 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RUFY3Q7L099 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RUFY3Q7L099 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RUFY3Q7L099 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RUFY3Q7L099 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RUFY3Q7L099 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RUFY3Q7L099 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RUFY3Q7L099 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RUFY3Q7L099 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RUFY3Q7L099 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RUFY3Q7L099 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RUFY3Q7L099 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RUFY3Q7L099 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RUFY3Q7L099 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RUFY3Q7L099 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RUFY3Q7L099 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RUFY3Q7L099 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RUFY3Q7L099 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RUFY3Q7L099 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RUFY3Q7L099 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
RUFY3Q7L099 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RUFY3Q7L099 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RUFY3Q7L099 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RUFY3Q7L099 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RUFY3Q7L099 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
RUFY3Q7L099 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RUFY3Q7L099 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RUFY3Q7L099 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
RUFY3Q7L099 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RUFY3Q7L099 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RUFY3Q7L099 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
RUFY3Q7L099 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RUFY3Q7L099 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RUFY3Q7L099 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RUFY3Q7L099 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RUFY3Q7L099 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RUFY3Q7L099 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RUFY3Q7L099 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RUFY3Q7L099 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RUFY3Q7L099 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RUFY3Q7L099 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RUFY3Q7L099 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RUFY3Q7L099 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RUFY3Q7L099 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms