Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL3

USP50, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 50, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP50Q70EL3 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
USP50Q70EL3 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP50Q70EL3 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
USP50Q70EL3 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP50Q70EL3 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
USP50Q70EL3 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP50Q70EL3 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP50Q70EL3 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP50Q70EL3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP50Q70EL3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP50Q70EL3 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP50Q70EL3 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP50Q70EL3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP50Q70EL3 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP50Q70EL3 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP50Q70EL3 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP50Q70EL3 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP50Q70EL3 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP50Q70EL3 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
USP50Q70EL3 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP50Q70EL3 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP50Q70EL3 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP50Q70EL3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP50Q70EL3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP50Q70EL3 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP50Q70EL3 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP50Q70EL3 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP50Q70EL3 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP50Q70EL3 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP50Q70EL3 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP50Q70EL3 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP50Q70EL3 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP50Q70EL3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP50Q70EL3 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP50Q70EL3 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
USP50Q70EL3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP50Q70EL3 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP50Q70EL3 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP50Q70EL3 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP50Q70EL3 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP50Q70EL3 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP50Q70EL3 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
USP50Q70EL3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP50Q70EL3 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP50Q70EL3 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP50Q70EL3 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP50Q70EL3 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP50Q70EL3 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP50Q70EL3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP50Q70EL3 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP50Q70EL3 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP50Q70EL3 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP50Q70EL3 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP50Q70EL3 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP50Q70EL3 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP50Q70EL3 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP50Q70EL3 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
USP50Q70EL3 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP50Q70EL3 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP50Q70EL3 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP50Q70EL3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP50Q70EL3 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP50Q70EL3 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP50Q70EL3 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP50Q70EL3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP50Q70EL3 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP50Q70EL3 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP50Q70EL3 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP50Q70EL3 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP50Q70EL3 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP50Q70EL3 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP50Q70EL3 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP50Q70EL3 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
USP50Q70EL3 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP50Q70EL3 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP50Q70EL3 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP50Q70EL3 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
USP50Q70EL3 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP50Q70EL3 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP50Q70EL3 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP50Q70EL3 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP50Q70EL3 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP50Q70EL3 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP50Q70EL3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP50Q70EL3 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP50Q70EL3 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP50Q70EL3 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP50Q70EL3 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP50Q70EL3 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP50Q70EL3 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP50Q70EL3 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP50Q70EL3 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP50Q70EL3 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP50Q70EL3 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP50Q70EL3 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP50Q70EL3 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP50Q70EL3 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP50Q70EL3 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP50Q70EL3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
USP50Q70EL3 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms