Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW61

BBS12, Bardet-Biedl syndrome 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS12Q6ZW61 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BBS12Q6ZW61 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BBS12Q6ZW61 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BBS12Q6ZW61 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BBS12Q6ZW61 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BBS12Q6ZW61 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BBS12Q6ZW61 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BBS12Q6ZW61 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BBS12Q6ZW61 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BBS12Q6ZW61 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BBS12Q6ZW61 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BBS12Q6ZW61 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BBS12Q6ZW61 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BBS12Q6ZW61 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BBS12Q6ZW61 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BBS12Q6ZW61 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BBS12Q6ZW61 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BBS12Q6ZW61 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BBS12Q6ZW61 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BBS12Q6ZW61 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BBS12Q6ZW61 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BBS12Q6ZW61 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BBS12Q6ZW61 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BBS12Q6ZW61 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
BBS12Q6ZW61 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
BBS12Q6ZW61 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BBS12Q6ZW61 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BBS12Q6ZW61 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BBS12Q6ZW61 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BBS12Q6ZW61 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BBS12Q6ZW61 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BBS12Q6ZW61 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BBS12Q6ZW61 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BBS12Q6ZW61 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BBS12Q6ZW61 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BBS12Q6ZW61 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BBS12Q6ZW61 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
BBS12Q6ZW61 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BBS12Q6ZW61 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
BBS12Q6ZW61 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
BBS12Q6ZW61 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
BBS12Q6ZW61 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
BBS12Q6ZW61 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
BBS12Q6ZW61 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BBS12Q6ZW61 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
BBS12Q6ZW61 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
BBS12Q6ZW61 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
BBS12Q6ZW61 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BBS12Q6ZW61 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
BBS12Q6ZW61 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
BBS12Q6ZW61 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
BBS12Q6ZW61 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
BBS12Q6ZW61 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
BBS12Q6ZW61 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
BBS12Q6ZW61 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
BBS12Q6ZW61 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
BBS12Q6ZW61 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BBS12Q6ZW61 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
BBS12Q6ZW61 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
BBS12Q6ZW61 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BBS12Q6ZW61 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
BBS12Q6ZW61 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
BBS12Q6ZW61 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
BBS12Q6ZW61 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
BBS12Q6ZW61 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
BBS12Q6ZW61 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BBS12Q6ZW61 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
BBS12Q6ZW61 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
BBS12Q6ZW61 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
BBS12Q6ZW61 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
BBS12Q6ZW61 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
BBS12Q6ZW61 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BBS12Q6ZW61 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
BBS12Q6ZW61 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
BBS12Q6ZW61 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
BBS12Q6ZW61 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
BBS12Q6ZW61 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
BBS12Q6ZW61 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BBS12Q6ZW61 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
BBS12Q6ZW61 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BBS12Q6ZW61 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BBS12Q6ZW61 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BBS12Q6ZW61 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BBS12Q6ZW61 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BBS12Q6ZW61 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BBS12Q6ZW61 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BBS12Q6ZW61 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BBS12Q6ZW61 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BBS12Q6ZW61 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BBS12Q6ZW61 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BBS12Q6ZW61 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
BBS12Q6ZW61 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BBS12Q6ZW61 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BBS12Q6ZW61 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BBS12Q6ZW61 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BBS12Q6ZW61 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BBS12Q6ZW61 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BBS12Q6ZW61 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BBS12Q6ZW61 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BBS12Q6ZW61 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms