Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSI9

CAPN12, Calpain-12, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN12Q6ZSI9 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CAPN12Q6ZSI9 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CAPN12Q6ZSI9 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CAPN12Q6ZSI9 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CAPN12Q6ZSI9 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CAPN12Q6ZSI9 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CAPN12Q6ZSI9 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CAPN12Q6ZSI9 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CAPN12Q6ZSI9 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CAPN12Q6ZSI9 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CAPN12Q6ZSI9 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CAPN12Q6ZSI9 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CAPN12Q6ZSI9 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CAPN12Q6ZSI9 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CAPN12Q6ZSI9 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CAPN12Q6ZSI9 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CAPN12Q6ZSI9 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CAPN12Q6ZSI9 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CAPN12Q6ZSI9 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CAPN12Q6ZSI9 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CAPN12Q6ZSI9 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CAPN12Q6ZSI9 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CAPN12Q6ZSI9 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CAPN12Q6ZSI9 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CAPN12Q6ZSI9 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CAPN12Q6ZSI9 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CAPN12Q6ZSI9 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CAPN12Q6ZSI9 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CAPN12Q6ZSI9 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CAPN12Q6ZSI9 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CAPN12Q6ZSI9 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CAPN12Q6ZSI9 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CAPN12Q6ZSI9 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CAPN12Q6ZSI9 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CAPN12Q6ZSI9 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CAPN12Q6ZSI9 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CAPN12Q6ZSI9 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CAPN12Q6ZSI9 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CAPN12Q6ZSI9 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CAPN12Q6ZSI9 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CAPN12Q6ZSI9 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CAPN12Q6ZSI9 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CAPN12Q6ZSI9 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CAPN12Q6ZSI9 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CAPN12Q6ZSI9 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CAPN12Q6ZSI9 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CAPN12Q6ZSI9 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CAPN12Q6ZSI9 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CAPN12Q6ZSI9 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CAPN12Q6ZSI9 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CAPN12Q6ZSI9 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CAPN12Q6ZSI9 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CAPN12Q6ZSI9 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CAPN12Q6ZSI9 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CAPN12Q6ZSI9 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CAPN12Q6ZSI9 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CAPN12Q6ZSI9 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CAPN12Q6ZSI9 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CAPN12Q6ZSI9 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CAPN12Q6ZSI9 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CAPN12Q6ZSI9 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CAPN12Q6ZSI9 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CAPN12Q6ZSI9 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CAPN12Q6ZSI9 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CAPN12Q6ZSI9 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CAPN12Q6ZSI9 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CAPN12Q6ZSI9 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CAPN12Q6ZSI9 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CAPN12Q6ZSI9 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CAPN12Q6ZSI9 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CAPN12Q6ZSI9 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CAPN12Q6ZSI9 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CAPN12Q6ZSI9 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CAPN12Q6ZSI9 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CAPN12Q6ZSI9 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CAPN12Q6ZSI9 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CAPN12Q6ZSI9 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CAPN12Q6ZSI9 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CAPN12Q6ZSI9 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CAPN12Q6ZSI9 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CAPN12Q6ZSI9 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CAPN12Q6ZSI9 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CAPN12Q6ZSI9 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CAPN12Q6ZSI9 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CAPN12Q6ZSI9 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CAPN12Q6ZSI9 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CAPN12Q6ZSI9 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CAPN12Q6ZSI9 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CAPN12Q6ZSI9 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CAPN12Q6ZSI9 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CAPN12Q6ZSI9 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CAPN12Q6ZSI9 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CAPN12Q6ZSI9 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CAPN12Q6ZSI9 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CAPN12Q6ZSI9 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CAPN12Q6ZSI9 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CAPN12Q6ZSI9 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CAPN12Q6ZSI9 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CAPN12Q6ZSI9 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CAPN12Q6ZSI9 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms