Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRK6

CCDC73, Coiled-coil domain-containing protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC73Q6ZRK6 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC73Q6ZRK6 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC73Q6ZRK6 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC73Q6ZRK6 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC73Q6ZRK6 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC73Q6ZRK6 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC73Q6ZRK6 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC73Q6ZRK6 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC73Q6ZRK6 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC73Q6ZRK6 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC73Q6ZRK6 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC73Q6ZRK6 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC73Q6ZRK6 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC73Q6ZRK6 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC73Q6ZRK6 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC73Q6ZRK6 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC73Q6ZRK6 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC73Q6ZRK6 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC73Q6ZRK6 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC73Q6ZRK6 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC73Q6ZRK6 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC73Q6ZRK6 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC73Q6ZRK6 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC73Q6ZRK6 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC73Q6ZRK6 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC73Q6ZRK6 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC73Q6ZRK6 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC73Q6ZRK6 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC73Q6ZRK6 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC73Q6ZRK6 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC73Q6ZRK6 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC73Q6ZRK6 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC73Q6ZRK6 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC73Q6ZRK6 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC73Q6ZRK6 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC73Q6ZRK6 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC73Q6ZRK6 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC73Q6ZRK6 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC73Q6ZRK6 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC73Q6ZRK6 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC73Q6ZRK6 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC73Q6ZRK6 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC73Q6ZRK6 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC73Q6ZRK6 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC73Q6ZRK6 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC73Q6ZRK6 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC73Q6ZRK6 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC73Q6ZRK6 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC73Q6ZRK6 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC73Q6ZRK6 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC73Q6ZRK6 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC73Q6ZRK6 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC73Q6ZRK6 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC73Q6ZRK6 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC73Q6ZRK6 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC73Q6ZRK6 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC73Q6ZRK6 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC73Q6ZRK6 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC73Q6ZRK6 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC73Q6ZRK6 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC73Q6ZRK6 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC73Q6ZRK6 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC73Q6ZRK6 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC73Q6ZRK6 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC73Q6ZRK6 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC73Q6ZRK6 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC73Q6ZRK6 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC73Q6ZRK6 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC73Q6ZRK6 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC73Q6ZRK6 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC73Q6ZRK6 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC73Q6ZRK6 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC73Q6ZRK6 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC73Q6ZRK6 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC73Q6ZRK6 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC73Q6ZRK6 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC73Q6ZRK6 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC73Q6ZRK6 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC73Q6ZRK6 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC73Q6ZRK6 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC73Q6ZRK6 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC73Q6ZRK6 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC73Q6ZRK6 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC73Q6ZRK6 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC73Q6ZRK6 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC73Q6ZRK6 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC73Q6ZRK6 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC73Q6ZRK6 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC73Q6ZRK6 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC73Q6ZRK6 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC73Q6ZRK6 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC73Q6ZRK6 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC73Q6ZRK6 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC73Q6ZRK6 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC73Q6ZRK6 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC73Q6ZRK6 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC73Q6ZRK6 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC73Q6ZRK6 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC73Q6ZRK6 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC73Q6ZRK6 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms