Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW40

RGMB, RGM domain family member B, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGMBQ6NW40 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RGMBQ6NW40 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RGMBQ6NW40 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RGMBQ6NW40 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RGMBQ6NW40 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RGMBQ6NW40 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RGMBQ6NW40 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RGMBQ6NW40 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RGMBQ6NW40 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RGMBQ6NW40 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RGMBQ6NW40 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RGMBQ6NW40 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RGMBQ6NW40 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RGMBQ6NW40 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RGMBQ6NW40 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RGMBQ6NW40 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RGMBQ6NW40 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RGMBQ6NW40 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RGMBQ6NW40 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RGMBQ6NW40 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RGMBQ6NW40 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RGMBQ6NW40 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RGMBQ6NW40 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RGMBQ6NW40 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RGMBQ6NW40 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RGMBQ6NW40 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RGMBQ6NW40 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RGMBQ6NW40 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RGMBQ6NW40 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RGMBQ6NW40 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RGMBQ6NW40 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RGMBQ6NW40 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RGMBQ6NW40 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RGMBQ6NW40 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RGMBQ6NW40 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RGMBQ6NW40 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RGMBQ6NW40 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RGMBQ6NW40 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RGMBQ6NW40 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RGMBQ6NW40 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RGMBQ6NW40 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RGMBQ6NW40 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RGMBQ6NW40 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RGMBQ6NW40 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RGMBQ6NW40 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RGMBQ6NW40 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RGMBQ6NW40 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RGMBQ6NW40 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RGMBQ6NW40 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RGMBQ6NW40 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RGMBQ6NW40 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RGMBQ6NW40 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RGMBQ6NW40 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RGMBQ6NW40 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RGMBQ6NW40 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RGMBQ6NW40 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RGMBQ6NW40 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RGMBQ6NW40 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RGMBQ6NW40 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RGMBQ6NW40 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC23■■□□□ 1.27
RGMBQ6NW40 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RGMBQ6NW40 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RGMBQ6NW40 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RGMBQ6NW40 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RGMBQ6NW40 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RGMBQ6NW40 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RGMBQ6NW40 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RGMBQ6NW40 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RGMBQ6NW40 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RGMBQ6NW40 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RGMBQ6NW40 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RGMBQ6NW40 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RGMBQ6NW40 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RGMBQ6NW40 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RGMBQ6NW40 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RGMBQ6NW40 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RGMBQ6NW40 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RGMBQ6NW40 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RGMBQ6NW40 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RGMBQ6NW40 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RGMBQ6NW40 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RGMBQ6NW40 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
RGMBQ6NW40 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RGMBQ6NW40 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RGMBQ6NW40 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
RGMBQ6NW40 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RGMBQ6NW40 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RGMBQ6NW40 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RGMBQ6NW40 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RGMBQ6NW40 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RGMBQ6NW40 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RGMBQ6NW40 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RGMBQ6NW40 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RGMBQ6NW40 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RGMBQ6NW40 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RGMBQ6NW40 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RGMBQ6NW40 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RGMBQ6NW40 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RGMBQ6NW40 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RGMBQ6NW40 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms