Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW7

NANOGP8, Putative homeobox protein NANOGP8, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP8Q6NSW7 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NANOGP8Q6NSW7 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NANOGP8Q6NSW7 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NANOGP8Q6NSW7 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NANOGP8Q6NSW7 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NANOGP8Q6NSW7 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NANOGP8Q6NSW7 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NANOGP8Q6NSW7 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NANOGP8Q6NSW7 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NANOGP8Q6NSW7 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NANOGP8Q6NSW7 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NANOGP8Q6NSW7 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NANOGP8Q6NSW7 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NANOGP8Q6NSW7 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NANOGP8Q6NSW7 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NANOGP8Q6NSW7 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NANOGP8Q6NSW7 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NANOGP8Q6NSW7 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NANOGP8Q6NSW7 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NANOGP8Q6NSW7 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NANOGP8Q6NSW7 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NANOGP8Q6NSW7 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NANOGP8Q6NSW7 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NANOGP8Q6NSW7 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NANOGP8Q6NSW7 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NANOGP8Q6NSW7 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NANOGP8Q6NSW7 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NANOGP8Q6NSW7 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NANOGP8Q6NSW7 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NANOGP8Q6NSW7 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NANOGP8Q6NSW7 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NANOGP8Q6NSW7 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NANOGP8Q6NSW7 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NANOGP8Q6NSW7 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NANOGP8Q6NSW7 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NANOGP8Q6NSW7 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NANOGP8Q6NSW7 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NANOGP8Q6NSW7 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
NANOGP8Q6NSW7 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NANOGP8Q6NSW7 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NANOGP8Q6NSW7 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NANOGP8Q6NSW7 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NANOGP8Q6NSW7 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NANOGP8Q6NSW7 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
NANOGP8Q6NSW7 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NANOGP8Q6NSW7 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
NANOGP8Q6NSW7 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NANOGP8Q6NSW7 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NANOGP8Q6NSW7 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NANOGP8Q6NSW7 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NANOGP8Q6NSW7 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
NANOGP8Q6NSW7 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
NANOGP8Q6NSW7 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
NANOGP8Q6NSW7 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
NANOGP8Q6NSW7 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
NANOGP8Q6NSW7 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NANOGP8Q6NSW7 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
NANOGP8Q6NSW7 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NANOGP8Q6NSW7 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NANOGP8Q6NSW7 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NANOGP8Q6NSW7 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NANOGP8Q6NSW7 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NANOGP8Q6NSW7 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NANOGP8Q6NSW7 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NANOGP8Q6NSW7 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NANOGP8Q6NSW7 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NANOGP8Q6NSW7 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NANOGP8Q6NSW7 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NANOGP8Q6NSW7 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
NANOGP8Q6NSW7 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NANOGP8Q6NSW7 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NANOGP8Q6NSW7 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NANOGP8Q6NSW7 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NANOGP8Q6NSW7 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NANOGP8Q6NSW7 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NANOGP8Q6NSW7 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NANOGP8Q6NSW7 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NANOGP8Q6NSW7 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NANOGP8Q6NSW7 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NANOGP8Q6NSW7 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NANOGP8Q6NSW7 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NANOGP8Q6NSW7 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NANOGP8Q6NSW7 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NANOGP8Q6NSW7 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NANOGP8Q6NSW7 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NANOGP8Q6NSW7 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NANOGP8Q6NSW7 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NANOGP8Q6NSW7 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NANOGP8Q6NSW7 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NANOGP8Q6NSW7 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NANOGP8Q6NSW7 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NANOGP8Q6NSW7 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NANOGP8Q6NSW7 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NANOGP8Q6NSW7 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NANOGP8Q6NSW7 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
NANOGP8Q6NSW7 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NANOGP8Q6NSW7 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NANOGP8Q6NSW7 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NANOGP8Q6NSW7 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NANOGP8Q6NSW7 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms