Protein–RNA interactions for Protein: Q68E01

INTS3, Integrator complex subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INTS3Q68E01 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
INTS3Q68E01 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
INTS3Q68E01 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
INTS3Q68E01 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
INTS3Q68E01 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
INTS3Q68E01 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
INTS3Q68E01 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
INTS3Q68E01 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
INTS3Q68E01 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
INTS3Q68E01 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
INTS3Q68E01 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
INTS3Q68E01 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
INTS3Q68E01 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
INTS3Q68E01 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
INTS3Q68E01 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
INTS3Q68E01 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
INTS3Q68E01 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
INTS3Q68E01 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
INTS3Q68E01 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
INTS3Q68E01 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
INTS3Q68E01 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
INTS3Q68E01 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
INTS3Q68E01 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
INTS3Q68E01 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
INTS3Q68E01 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
INTS3Q68E01 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
INTS3Q68E01 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
INTS3Q68E01 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
INTS3Q68E01 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
INTS3Q68E01 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
INTS3Q68E01 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
INTS3Q68E01 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
INTS3Q68E01 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
INTS3Q68E01 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
INTS3Q68E01 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
INTS3Q68E01 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
INTS3Q68E01 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
INTS3Q68E01 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
INTS3Q68E01 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
INTS3Q68E01 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
INTS3Q68E01 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
INTS3Q68E01 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
INTS3Q68E01 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
INTS3Q68E01 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
INTS3Q68E01 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
INTS3Q68E01 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
INTS3Q68E01 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
INTS3Q68E01 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
INTS3Q68E01 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
INTS3Q68E01 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
INTS3Q68E01 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
INTS3Q68E01 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
INTS3Q68E01 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
INTS3Q68E01 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
INTS3Q68E01 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
INTS3Q68E01 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
INTS3Q68E01 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
INTS3Q68E01 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
INTS3Q68E01 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
INTS3Q68E01 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.6
INTS3Q68E01 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
INTS3Q68E01 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
INTS3Q68E01 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
INTS3Q68E01 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
INTS3Q68E01 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
INTS3Q68E01 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
INTS3Q68E01 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
INTS3Q68E01 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
INTS3Q68E01 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
INTS3Q68E01 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
INTS3Q68E01 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
INTS3Q68E01 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
INTS3Q68E01 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
INTS3Q68E01 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
INTS3Q68E01 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
INTS3Q68E01 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
INTS3Q68E01 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
INTS3Q68E01 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
INTS3Q68E01 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
INTS3Q68E01 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
INTS3Q68E01 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
INTS3Q68E01 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
INTS3Q68E01 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
INTS3Q68E01 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
INTS3Q68E01 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
INTS3Q68E01 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
INTS3Q68E01 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
INTS3Q68E01 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
INTS3Q68E01 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
INTS3Q68E01 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
INTS3Q68E01 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
INTS3Q68E01 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC25■■□□□ 1.59
INTS3Q68E01 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
INTS3Q68E01 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
INTS3Q68E01 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
INTS3Q68E01 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
INTS3Q68E01 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
INTS3Q68E01 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
INTS3Q68E01 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
INTS3Q68E01 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms