Protein–RNA interactions for Protein: Q68CZ2

TNS3, Tensin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS3Q68CZ2 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TNS3Q68CZ2 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
TNS3Q68CZ2 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
TNS3Q68CZ2 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TNS3Q68CZ2 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TNS3Q68CZ2 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TNS3Q68CZ2 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TNS3Q68CZ2 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TNS3Q68CZ2 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TNS3Q68CZ2 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TNS3Q68CZ2 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TNS3Q68CZ2 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
TNS3Q68CZ2 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TNS3Q68CZ2 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TNS3Q68CZ2 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TNS3Q68CZ2 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TNS3Q68CZ2 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TNS3Q68CZ2 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
TNS3Q68CZ2 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TNS3Q68CZ2 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TNS3Q68CZ2 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TNS3Q68CZ2 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
TNS3Q68CZ2 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
TNS3Q68CZ2 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
TNS3Q68CZ2 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
TNS3Q68CZ2 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TNS3Q68CZ2 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TNS3Q68CZ2 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TNS3Q68CZ2 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TNS3Q68CZ2 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TNS3Q68CZ2 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
TNS3Q68CZ2 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
TNS3Q68CZ2 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TNS3Q68CZ2 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TNS3Q68CZ2 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
TNS3Q68CZ2 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TNS3Q68CZ2 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TNS3Q68CZ2 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TNS3Q68CZ2 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TNS3Q68CZ2 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TNS3Q68CZ2 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TNS3Q68CZ2 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TNS3Q68CZ2 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TNS3Q68CZ2 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
TNS3Q68CZ2 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
TNS3Q68CZ2 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TNS3Q68CZ2 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TNS3Q68CZ2 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TNS3Q68CZ2 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TNS3Q68CZ2 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
TNS3Q68CZ2 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TNS3Q68CZ2 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TNS3Q68CZ2 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TNS3Q68CZ2 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TNS3Q68CZ2 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TNS3Q68CZ2 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
TNS3Q68CZ2 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TNS3Q68CZ2 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TNS3Q68CZ2 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TNS3Q68CZ2 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TNS3Q68CZ2 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TNS3Q68CZ2 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TNS3Q68CZ2 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TNS3Q68CZ2 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TNS3Q68CZ2 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TNS3Q68CZ2 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TNS3Q68CZ2 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TNS3Q68CZ2 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TNS3Q68CZ2 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
TNS3Q68CZ2 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TNS3Q68CZ2 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TNS3Q68CZ2 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TNS3Q68CZ2 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TNS3Q68CZ2 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TNS3Q68CZ2 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TNS3Q68CZ2 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TNS3Q68CZ2 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TNS3Q68CZ2 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TNS3Q68CZ2 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TNS3Q68CZ2 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TNS3Q68CZ2 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TNS3Q68CZ2 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TNS3Q68CZ2 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TNS3Q68CZ2 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TNS3Q68CZ2 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TNS3Q68CZ2 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
TNS3Q68CZ2 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TNS3Q68CZ2 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TNS3Q68CZ2 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TNS3Q68CZ2 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
TNS3Q68CZ2 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TNS3Q68CZ2 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TNS3Q68CZ2 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TNS3Q68CZ2 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
TNS3Q68CZ2 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TNS3Q68CZ2 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
TNS3Q68CZ2 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TNS3Q68CZ2 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TNS3Q68CZ2 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TNS3Q68CZ2 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms