Protein–RNA interactions for Protein: Q658N2

WSCD1, WSC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WSCD1Q658N2 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
WSCD1Q658N2 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
WSCD1Q658N2 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
WSCD1Q658N2 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
WSCD1Q658N2 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
WSCD1Q658N2 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
WSCD1Q658N2 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
WSCD1Q658N2 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
WSCD1Q658N2 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
WSCD1Q658N2 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
WSCD1Q658N2 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
WSCD1Q658N2 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
WSCD1Q658N2 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
WSCD1Q658N2 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
WSCD1Q658N2 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
WSCD1Q658N2 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
WSCD1Q658N2 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
WSCD1Q658N2 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
WSCD1Q658N2 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
WSCD1Q658N2 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
WSCD1Q658N2 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
WSCD1Q658N2 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
WSCD1Q658N2 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
WSCD1Q658N2 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
WSCD1Q658N2 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
WSCD1Q658N2 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
WSCD1Q658N2 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
WSCD1Q658N2 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
WSCD1Q658N2 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
WSCD1Q658N2 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
WSCD1Q658N2 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
WSCD1Q658N2 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
WSCD1Q658N2 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
WSCD1Q658N2 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
WSCD1Q658N2 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
WSCD1Q658N2 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
WSCD1Q658N2 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
WSCD1Q658N2 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
WSCD1Q658N2 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
WSCD1Q658N2 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
WSCD1Q658N2 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
WSCD1Q658N2 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
WSCD1Q658N2 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
WSCD1Q658N2 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
WSCD1Q658N2 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
WSCD1Q658N2 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
WSCD1Q658N2 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
WSCD1Q658N2 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
WSCD1Q658N2 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
WSCD1Q658N2 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
WSCD1Q658N2 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
WSCD1Q658N2 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
WSCD1Q658N2 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
WSCD1Q658N2 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
WSCD1Q658N2 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
WSCD1Q658N2 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
WSCD1Q658N2 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
WSCD1Q658N2 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
WSCD1Q658N2 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
WSCD1Q658N2 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
WSCD1Q658N2 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
WSCD1Q658N2 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
WSCD1Q658N2 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
WSCD1Q658N2 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
WSCD1Q658N2 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
WSCD1Q658N2 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
WSCD1Q658N2 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
WSCD1Q658N2 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
WSCD1Q658N2 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
WSCD1Q658N2 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
WSCD1Q658N2 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
WSCD1Q658N2 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
WSCD1Q658N2 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
WSCD1Q658N2 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
WSCD1Q658N2 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
WSCD1Q658N2 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
WSCD1Q658N2 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
WSCD1Q658N2 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
WSCD1Q658N2 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
WSCD1Q658N2 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
WSCD1Q658N2 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
WSCD1Q658N2 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
WSCD1Q658N2 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
WSCD1Q658N2 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
WSCD1Q658N2 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
WSCD1Q658N2 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
WSCD1Q658N2 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
WSCD1Q658N2 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
WSCD1Q658N2 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
WSCD1Q658N2 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
WSCD1Q658N2 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
WSCD1Q658N2 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
WSCD1Q658N2 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
WSCD1Q658N2 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
WSCD1Q658N2 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
WSCD1Q658N2 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
WSCD1Q658N2 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
WSCD1Q658N2 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
WSCD1Q658N2 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
WSCD1Q658N2 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms