Protein–RNA interactions for Protein: Q63HN8

RNF213, E3 ubiquitin-protein ligase RNF213, humanhuman

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Length 5,207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF213Q63HN8 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RNF213Q63HN8 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RNF213Q63HN8 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
RNF213Q63HN8 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RNF213Q63HN8 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RNF213Q63HN8 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RNF213Q63HN8 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
RNF213Q63HN8 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RNF213Q63HN8 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RNF213Q63HN8 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RNF213Q63HN8 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
RNF213Q63HN8 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RNF213Q63HN8 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RNF213Q63HN8 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RNF213Q63HN8 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RNF213Q63HN8 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RNF213Q63HN8 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.71
RNF213Q63HN8 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.71
RNF213Q63HN8 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
RNF213Q63HN8 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.71
RNF213Q63HN8 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
RNF213Q63HN8 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
RNF213Q63HN8 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
RNF213Q63HN8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
RNF213Q63HN8 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
RNF213Q63HN8 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
RNF213Q63HN8 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.71
RNF213Q63HN8 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
RNF213Q63HN8 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RNF213Q63HN8 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RNF213Q63HN8 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RNF213Q63HN8 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RNF213Q63HN8 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RNF213Q63HN8 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RNF213Q63HN8 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RNF213Q63HN8 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RNF213Q63HN8 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RNF213Q63HN8 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
RNF213Q63HN8 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RNF213Q63HN8 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RNF213Q63HN8 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
RNF213Q63HN8 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RNF213Q63HN8 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RNF213Q63HN8 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RNF213Q63HN8 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RNF213Q63HN8 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RNF213Q63HN8 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RNF213Q63HN8 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RNF213Q63HN8 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RNF213Q63HN8 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RNF213Q63HN8 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RNF213Q63HN8 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RNF213Q63HN8 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RNF213Q63HN8 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RNF213Q63HN8 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RNF213Q63HN8 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RNF213Q63HN8 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RNF213Q63HN8 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RNF213Q63HN8 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RNF213Q63HN8 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RNF213Q63HN8 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RNF213Q63HN8 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RNF213Q63HN8 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
RNF213Q63HN8 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RNF213Q63HN8 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RNF213Q63HN8 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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RNF213Q63HN8 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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RNF213Q63HN8 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RNF213Q63HN8 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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RNF213Q63HN8 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RNF213Q63HN8 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RNF213Q63HN8 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RNF213Q63HN8 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RNF213Q63HN8 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
RNF213Q63HN8 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RNF213Q63HN8 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RNF213Q63HN8 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RNF213Q63HN8 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
RNF213Q63HN8 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RNF213Q63HN8 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RNF213Q63HN8 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RNF213Q63HN8 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RNF213Q63HN8 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RNF213Q63HN8 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RNF213Q63HN8 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RNF213Q63HN8 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
RNF213Q63HN8 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RNF213Q63HN8 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RNF213Q63HN8 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RNF213Q63HN8 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RNF213Q63HN8 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RNF213Q63HN8 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RNF213Q63HN8 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RNF213Q63HN8 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
RNF213Q63HN8 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
RNF213Q63HN8 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RNF213Q63HN8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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