Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYK3

ECM29, Proteasome-associated protein ECM29 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM29Q5VYK3 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ECM29Q5VYK3 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ECM29Q5VYK3 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ECM29Q5VYK3 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ECM29Q5VYK3 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ECM29Q5VYK3 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ECM29Q5VYK3 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ECM29Q5VYK3 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ECM29Q5VYK3 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ECM29Q5VYK3 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ECM29Q5VYK3 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ECM29Q5VYK3 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ECM29Q5VYK3 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ECM29Q5VYK3 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ECM29Q5VYK3 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ECM29Q5VYK3 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ECM29Q5VYK3 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ECM29Q5VYK3 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ECM29Q5VYK3 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ECM29Q5VYK3 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ECM29Q5VYK3 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
ECM29Q5VYK3 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ECM29Q5VYK3 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ECM29Q5VYK3 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ECM29Q5VYK3 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ECM29Q5VYK3 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ECM29Q5VYK3 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
ECM29Q5VYK3 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ECM29Q5VYK3 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ECM29Q5VYK3 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ECM29Q5VYK3 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ECM29Q5VYK3 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ECM29Q5VYK3 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ECM29Q5VYK3 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ECM29Q5VYK3 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ECM29Q5VYK3 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ECM29Q5VYK3 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ECM29Q5VYK3 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ECM29Q5VYK3 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ECM29Q5VYK3 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ECM29Q5VYK3 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ECM29Q5VYK3 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ECM29Q5VYK3 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ECM29Q5VYK3 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ECM29Q5VYK3 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ECM29Q5VYK3 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ECM29Q5VYK3 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
ECM29Q5VYK3 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
ECM29Q5VYK3 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ECM29Q5VYK3 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ECM29Q5VYK3 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ECM29Q5VYK3 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ECM29Q5VYK3 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ECM29Q5VYK3 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ECM29Q5VYK3 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ECM29Q5VYK3 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ECM29Q5VYK3 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
ECM29Q5VYK3 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ECM29Q5VYK3 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ECM29Q5VYK3 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ECM29Q5VYK3 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ECM29Q5VYK3 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
ECM29Q5VYK3 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ECM29Q5VYK3 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ECM29Q5VYK3 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ECM29Q5VYK3 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ECM29Q5VYK3 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ECM29Q5VYK3 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ECM29Q5VYK3 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ECM29Q5VYK3 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ECM29Q5VYK3 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ECM29Q5VYK3 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ECM29Q5VYK3 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ECM29Q5VYK3 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ECM29Q5VYK3 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ECM29Q5VYK3 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ECM29Q5VYK3 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ECM29Q5VYK3 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ECM29Q5VYK3 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ECM29Q5VYK3 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ECM29Q5VYK3 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
ECM29Q5VYK3 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ECM29Q5VYK3 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
ECM29Q5VYK3 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ECM29Q5VYK3 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ECM29Q5VYK3 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ECM29Q5VYK3 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ECM29Q5VYK3 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ECM29Q5VYK3 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ECM29Q5VYK3 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ECM29Q5VYK3 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
ECM29Q5VYK3 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ECM29Q5VYK3 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ECM29Q5VYK3 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ECM29Q5VYK3 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
ECM29Q5VYK3 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ECM29Q5VYK3 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ECM29Q5VYK3 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ECM29Q5VYK3 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ECM29Q5VYK3 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms