Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSL9

STRIP1, Striatin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRIP1Q5VSL9 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
STRIP1Q5VSL9 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
STRIP1Q5VSL9 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
STRIP1Q5VSL9 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
STRIP1Q5VSL9 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
STRIP1Q5VSL9 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
STRIP1Q5VSL9 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
STRIP1Q5VSL9 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
STRIP1Q5VSL9 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
STRIP1Q5VSL9 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
STRIP1Q5VSL9 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
STRIP1Q5VSL9 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
STRIP1Q5VSL9 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
STRIP1Q5VSL9 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
STRIP1Q5VSL9 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
STRIP1Q5VSL9 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
STRIP1Q5VSL9 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
STRIP1Q5VSL9 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
STRIP1Q5VSL9 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
STRIP1Q5VSL9 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
STRIP1Q5VSL9 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
STRIP1Q5VSL9 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
STRIP1Q5VSL9 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
STRIP1Q5VSL9 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
STRIP1Q5VSL9 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
STRIP1Q5VSL9 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
STRIP1Q5VSL9 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
STRIP1Q5VSL9 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
STRIP1Q5VSL9 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
STRIP1Q5VSL9 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
STRIP1Q5VSL9 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
STRIP1Q5VSL9 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
STRIP1Q5VSL9 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
STRIP1Q5VSL9 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
STRIP1Q5VSL9 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
STRIP1Q5VSL9 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
STRIP1Q5VSL9 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
STRIP1Q5VSL9 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
STRIP1Q5VSL9 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
STRIP1Q5VSL9 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
STRIP1Q5VSL9 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
STRIP1Q5VSL9 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
STRIP1Q5VSL9 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
STRIP1Q5VSL9 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
STRIP1Q5VSL9 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
STRIP1Q5VSL9 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
STRIP1Q5VSL9 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
STRIP1Q5VSL9 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
STRIP1Q5VSL9 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
STRIP1Q5VSL9 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
STRIP1Q5VSL9 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
STRIP1Q5VSL9 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
STRIP1Q5VSL9 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
STRIP1Q5VSL9 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
STRIP1Q5VSL9 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
STRIP1Q5VSL9 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
STRIP1Q5VSL9 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
STRIP1Q5VSL9 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
STRIP1Q5VSL9 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
STRIP1Q5VSL9 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
STRIP1Q5VSL9 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
STRIP1Q5VSL9 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
STRIP1Q5VSL9 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
STRIP1Q5VSL9 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
STRIP1Q5VSL9 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
STRIP1Q5VSL9 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
STRIP1Q5VSL9 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
STRIP1Q5VSL9 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
STRIP1Q5VSL9 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
STRIP1Q5VSL9 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
STRIP1Q5VSL9 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
STRIP1Q5VSL9 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
STRIP1Q5VSL9 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
STRIP1Q5VSL9 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
STRIP1Q5VSL9 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
STRIP1Q5VSL9 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
STRIP1Q5VSL9 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
STRIP1Q5VSL9 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
STRIP1Q5VSL9 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
STRIP1Q5VSL9 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
STRIP1Q5VSL9 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
STRIP1Q5VSL9 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
STRIP1Q5VSL9 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
STRIP1Q5VSL9 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
STRIP1Q5VSL9 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
STRIP1Q5VSL9 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
STRIP1Q5VSL9 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
STRIP1Q5VSL9 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
STRIP1Q5VSL9 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
STRIP1Q5VSL9 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
STRIP1Q5VSL9 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
STRIP1Q5VSL9 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
STRIP1Q5VSL9 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
STRIP1Q5VSL9 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
STRIP1Q5VSL9 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
STRIP1Q5VSL9 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
STRIP1Q5VSL9 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
STRIP1Q5VSL9 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
STRIP1Q5VSL9 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
STRIP1Q5VSL9 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms