Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGL8

PXDC1, PX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXDC1Q5TGL8 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PXDC1Q5TGL8 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PXDC1Q5TGL8 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PXDC1Q5TGL8 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PXDC1Q5TGL8 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PXDC1Q5TGL8 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PXDC1Q5TGL8 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PXDC1Q5TGL8 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PXDC1Q5TGL8 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PXDC1Q5TGL8 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PXDC1Q5TGL8 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PXDC1Q5TGL8 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PXDC1Q5TGL8 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PXDC1Q5TGL8 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PXDC1Q5TGL8 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PXDC1Q5TGL8 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PXDC1Q5TGL8 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PXDC1Q5TGL8 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PXDC1Q5TGL8 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PXDC1Q5TGL8 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PXDC1Q5TGL8 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PXDC1Q5TGL8 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PXDC1Q5TGL8 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PXDC1Q5TGL8 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PXDC1Q5TGL8 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PXDC1Q5TGL8 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PXDC1Q5TGL8 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PXDC1Q5TGL8 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PXDC1Q5TGL8 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PXDC1Q5TGL8 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PXDC1Q5TGL8 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PXDC1Q5TGL8 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PXDC1Q5TGL8 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PXDC1Q5TGL8 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PXDC1Q5TGL8 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PXDC1Q5TGL8 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PXDC1Q5TGL8 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PXDC1Q5TGL8 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PXDC1Q5TGL8 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PXDC1Q5TGL8 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PXDC1Q5TGL8 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PXDC1Q5TGL8 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PXDC1Q5TGL8 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PXDC1Q5TGL8 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PXDC1Q5TGL8 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PXDC1Q5TGL8 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PXDC1Q5TGL8 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PXDC1Q5TGL8 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PXDC1Q5TGL8 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PXDC1Q5TGL8 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PXDC1Q5TGL8 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PXDC1Q5TGL8 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PXDC1Q5TGL8 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PXDC1Q5TGL8 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PXDC1Q5TGL8 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PXDC1Q5TGL8 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PXDC1Q5TGL8 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PXDC1Q5TGL8 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PXDC1Q5TGL8 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PXDC1Q5TGL8 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PXDC1Q5TGL8 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PXDC1Q5TGL8 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PXDC1Q5TGL8 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PXDC1Q5TGL8 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PXDC1Q5TGL8 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PXDC1Q5TGL8 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PXDC1Q5TGL8 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PXDC1Q5TGL8 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PXDC1Q5TGL8 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PXDC1Q5TGL8 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PXDC1Q5TGL8 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PXDC1Q5TGL8 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PXDC1Q5TGL8 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PXDC1Q5TGL8 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PXDC1Q5TGL8 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PXDC1Q5TGL8 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PXDC1Q5TGL8 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PXDC1Q5TGL8 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PXDC1Q5TGL8 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PXDC1Q5TGL8 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PXDC1Q5TGL8 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PXDC1Q5TGL8 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PXDC1Q5TGL8 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PXDC1Q5TGL8 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PXDC1Q5TGL8 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PXDC1Q5TGL8 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PXDC1Q5TGL8 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PXDC1Q5TGL8 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PXDC1Q5TGL8 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PXDC1Q5TGL8 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PXDC1Q5TGL8 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PXDC1Q5TGL8 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PXDC1Q5TGL8 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PXDC1Q5TGL8 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PXDC1Q5TGL8 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PXDC1Q5TGL8 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PXDC1Q5TGL8 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PXDC1Q5TGL8 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PXDC1Q5TGL8 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PXDC1Q5TGL8 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms