Protein–RNA interactions for Protein: Q5MIZ7

PPP4R3B, Serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 3B, humanhuman

Predictions only

Length 849 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4R3BQ5MIZ7 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPP4R3BQ5MIZ7 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPP4R3BQ5MIZ7 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPP4R3BQ5MIZ7 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPP4R3BQ5MIZ7 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPP4R3BQ5MIZ7 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPP4R3BQ5MIZ7 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PPP4R3BQ5MIZ7 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPP4R3BQ5MIZ7 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPP4R3BQ5MIZ7 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPP4R3BQ5MIZ7 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPP4R3BQ5MIZ7 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPP4R3BQ5MIZ7 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPP4R3BQ5MIZ7 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PPP4R3BQ5MIZ7 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPP4R3BQ5MIZ7 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPP4R3BQ5MIZ7 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPP4R3BQ5MIZ7 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPP4R3BQ5MIZ7 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPP4R3BQ5MIZ7 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPP4R3BQ5MIZ7 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPP4R3BQ5MIZ7 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPP4R3BQ5MIZ7 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPP4R3BQ5MIZ7 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PPP4R3BQ5MIZ7 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPP4R3BQ5MIZ7 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPP4R3BQ5MIZ7 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPP4R3BQ5MIZ7 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPP4R3BQ5MIZ7 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPP4R3BQ5MIZ7 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPP4R3BQ5MIZ7 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPP4R3BQ5MIZ7 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PPP4R3BQ5MIZ7 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PPP4R3BQ5MIZ7 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPP4R3BQ5MIZ7 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPP4R3BQ5MIZ7 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPP4R3BQ5MIZ7 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPP4R3BQ5MIZ7 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPP4R3BQ5MIZ7 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPP4R3BQ5MIZ7 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPP4R3BQ5MIZ7 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPP4R3BQ5MIZ7 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPP4R3BQ5MIZ7 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPP4R3BQ5MIZ7 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPP4R3BQ5MIZ7 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPP4R3BQ5MIZ7 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPP4R3BQ5MIZ7 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPP4R3BQ5MIZ7 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPP4R3BQ5MIZ7 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPP4R3BQ5MIZ7 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPP4R3BQ5MIZ7 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPP4R3BQ5MIZ7 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPP4R3BQ5MIZ7 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPP4R3BQ5MIZ7 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPP4R3BQ5MIZ7 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PPP4R3BQ5MIZ7 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPP4R3BQ5MIZ7 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPP4R3BQ5MIZ7 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPP4R3BQ5MIZ7 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPP4R3BQ5MIZ7 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPP4R3BQ5MIZ7 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPP4R3BQ5MIZ7 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPP4R3BQ5MIZ7 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPP4R3BQ5MIZ7 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPP4R3BQ5MIZ7 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPP4R3BQ5MIZ7 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPP4R3BQ5MIZ7 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPP4R3BQ5MIZ7 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PPP4R3BQ5MIZ7 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PPP4R3BQ5MIZ7 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PPP4R3BQ5MIZ7 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PPP4R3BQ5MIZ7 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PPP4R3BQ5MIZ7 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PPP4R3BQ5MIZ7 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PPP4R3BQ5MIZ7 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PPP4R3BQ5MIZ7 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PPP4R3BQ5MIZ7 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PPP4R3BQ5MIZ7 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PPP4R3BQ5MIZ7 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PPP4R3BQ5MIZ7 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PPP4R3BQ5MIZ7 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PPP4R3BQ5MIZ7 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PPP4R3BQ5MIZ7 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PPP4R3BQ5MIZ7 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PPP4R3BQ5MIZ7 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPP4R3BQ5MIZ7 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPP4R3BQ5MIZ7 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPP4R3BQ5MIZ7 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPP4R3BQ5MIZ7 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPP4R3BQ5MIZ7 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPP4R3BQ5MIZ7 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPP4R3BQ5MIZ7 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPP4R3BQ5MIZ7 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPP4R3BQ5MIZ7 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPP4R3BQ5MIZ7 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPP4R3BQ5MIZ7 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPP4R3BQ5MIZ7 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPP4R3BQ5MIZ7 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPP4R3BQ5MIZ7 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPP4R3BQ5MIZ7 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms