Protein–RNA interactions for Protein: Q5M9N0

CCDC158, Coiled-coil domain-containing protein 158, humanhuman

Predictions only

Length 1,113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC158Q5M9N0 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC158Q5M9N0 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC158Q5M9N0 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC158Q5M9N0 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC158Q5M9N0 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC158Q5M9N0 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC158Q5M9N0 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC158Q5M9N0 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC158Q5M9N0 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC158Q5M9N0 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC158Q5M9N0 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC158Q5M9N0 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC158Q5M9N0 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC158Q5M9N0 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC158Q5M9N0 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC158Q5M9N0 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC158Q5M9N0 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC158Q5M9N0 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC158Q5M9N0 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC158Q5M9N0 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC158Q5M9N0 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC158Q5M9N0 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC158Q5M9N0 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC158Q5M9N0 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC158Q5M9N0 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC158Q5M9N0 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC158Q5M9N0 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC158Q5M9N0 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC158Q5M9N0 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC158Q5M9N0 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC158Q5M9N0 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC158Q5M9N0 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC158Q5M9N0 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC158Q5M9N0 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC158Q5M9N0 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC158Q5M9N0 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC158Q5M9N0 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC158Q5M9N0 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC158Q5M9N0 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC158Q5M9N0 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC158Q5M9N0 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC158Q5M9N0 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC158Q5M9N0 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC158Q5M9N0 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC158Q5M9N0 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC158Q5M9N0 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC158Q5M9N0 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC158Q5M9N0 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC158Q5M9N0 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC158Q5M9N0 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC158Q5M9N0 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC158Q5M9N0 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC158Q5M9N0 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC158Q5M9N0 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC158Q5M9N0 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC158Q5M9N0 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC158Q5M9N0 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC158Q5M9N0 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC158Q5M9N0 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC158Q5M9N0 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC158Q5M9N0 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC158Q5M9N0 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC158Q5M9N0 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC158Q5M9N0 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC158Q5M9N0 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC158Q5M9N0 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC158Q5M9N0 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC158Q5M9N0 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC158Q5M9N0 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC158Q5M9N0 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC158Q5M9N0 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC158Q5M9N0 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC158Q5M9N0 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC158Q5M9N0 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC158Q5M9N0 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC158Q5M9N0 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC158Q5M9N0 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC158Q5M9N0 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC158Q5M9N0 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC158Q5M9N0 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC158Q5M9N0 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC158Q5M9N0 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC158Q5M9N0 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC158Q5M9N0 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC158Q5M9N0 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC158Q5M9N0 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC158Q5M9N0 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC158Q5M9N0 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC158Q5M9N0 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC158Q5M9N0 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC158Q5M9N0 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC158Q5M9N0 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC158Q5M9N0 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC158Q5M9N0 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC158Q5M9N0 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC158Q5M9N0 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC158Q5M9N0 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC158Q5M9N0 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC158Q5M9N0 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC158Q5M9N0 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms