Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RAB6CQ53S08 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RAB6CQ53S08 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RAB6CQ53S08 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RAB6CQ53S08 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RAB6CQ53S08 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RAB6CQ53S08 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RAB6CQ53S08 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RAB6CQ53S08 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RAB6CQ53S08 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RAB6CQ53S08 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RAB6CQ53S08 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RAB6CQ53S08 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RAB6CQ53S08 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RAB6CQ53S08 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RAB6CQ53S08 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
RAB6CQ53S08 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RAB6CQ53S08 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RAB6CQ53S08 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
RAB6CQ53S08 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RAB6CQ53S08 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RAB6CQ53S08 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RAB6CQ53S08 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RAB6CQ53S08 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RAB6CQ53S08 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB6CQ53S08 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB6CQ53S08 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB6CQ53S08 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB6CQ53S08 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB6CQ53S08 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB6CQ53S08 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB6CQ53S08 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB6CQ53S08 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB6CQ53S08 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB6CQ53S08 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB6CQ53S08 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB6CQ53S08 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB6CQ53S08 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB6CQ53S08 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB6CQ53S08 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB6CQ53S08 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB6CQ53S08 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB6CQ53S08 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB6CQ53S08 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB6CQ53S08 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB6CQ53S08 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB6CQ53S08 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RAB6CQ53S08 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RAB6CQ53S08 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RAB6CQ53S08 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RAB6CQ53S08 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RAB6CQ53S08 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RAB6CQ53S08 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RAB6CQ53S08 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
RAB6CQ53S08 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RAB6CQ53S08 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RAB6CQ53S08 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RAB6CQ53S08 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RAB6CQ53S08 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RAB6CQ53S08 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RAB6CQ53S08 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RAB6CQ53S08 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RAB6CQ53S08 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RAB6CQ53S08 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RAB6CQ53S08 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RAB6CQ53S08 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RAB6CQ53S08 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RAB6CQ53S08 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RAB6CQ53S08 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RAB6CQ53S08 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RAB6CQ53S08 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RAB6CQ53S08 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RAB6CQ53S08 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RAB6CQ53S08 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RAB6CQ53S08 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RAB6CQ53S08 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RAB6CQ53S08 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RAB6CQ53S08 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RAB6CQ53S08 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RAB6CQ53S08 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RAB6CQ53S08 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RAB6CQ53S08 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RAB6CQ53S08 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RAB6CQ53S08 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RAB6CQ53S08 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RAB6CQ53S08 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RAB6CQ53S08 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RAB6CQ53S08 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RAB6CQ53S08 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RAB6CQ53S08 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RAB6CQ53S08 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
RAB6CQ53S08 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RAB6CQ53S08 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RAB6CQ53S08 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RAB6CQ53S08 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RAB6CQ53S08 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RAB6CQ53S08 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RAB6CQ53S08 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RAB6CQ53S08 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RAB6CQ53S08 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms