Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0U5

CFAP221, Cilia- and flagella-associated protein 221, humanhuman

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP221Q4G0U5 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CFAP221Q4G0U5 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CFAP221Q4G0U5 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CFAP221Q4G0U5 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CFAP221Q4G0U5 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CFAP221Q4G0U5 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CFAP221Q4G0U5 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CFAP221Q4G0U5 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CFAP221Q4G0U5 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CFAP221Q4G0U5 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CFAP221Q4G0U5 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CFAP221Q4G0U5 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CFAP221Q4G0U5 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CFAP221Q4G0U5 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CFAP221Q4G0U5 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CFAP221Q4G0U5 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CFAP221Q4G0U5 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CFAP221Q4G0U5 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CFAP221Q4G0U5 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CFAP221Q4G0U5 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CFAP221Q4G0U5 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CFAP221Q4G0U5 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CFAP221Q4G0U5 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CFAP221Q4G0U5 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CFAP221Q4G0U5 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CFAP221Q4G0U5 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CFAP221Q4G0U5 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CFAP221Q4G0U5 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CFAP221Q4G0U5 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CFAP221Q4G0U5 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CFAP221Q4G0U5 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CFAP221Q4G0U5 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CFAP221Q4G0U5 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CFAP221Q4G0U5 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CFAP221Q4G0U5 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CFAP221Q4G0U5 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CFAP221Q4G0U5 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CFAP221Q4G0U5 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CFAP221Q4G0U5 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CFAP221Q4G0U5 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CFAP221Q4G0U5 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CFAP221Q4G0U5 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CFAP221Q4G0U5 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CFAP221Q4G0U5 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CFAP221Q4G0U5 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CFAP221Q4G0U5 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CFAP221Q4G0U5 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CFAP221Q4G0U5 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CFAP221Q4G0U5 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CFAP221Q4G0U5 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CFAP221Q4G0U5 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CFAP221Q4G0U5 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CFAP221Q4G0U5 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CFAP221Q4G0U5 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CFAP221Q4G0U5 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CFAP221Q4G0U5 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CFAP221Q4G0U5 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CFAP221Q4G0U5 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CFAP221Q4G0U5 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CFAP221Q4G0U5 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CFAP221Q4G0U5 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CFAP221Q4G0U5 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CFAP221Q4G0U5 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CFAP221Q4G0U5 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CFAP221Q4G0U5 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CFAP221Q4G0U5 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CFAP221Q4G0U5 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CFAP221Q4G0U5 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CFAP221Q4G0U5 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CFAP221Q4G0U5 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CFAP221Q4G0U5 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CFAP221Q4G0U5 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CFAP221Q4G0U5 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CFAP221Q4G0U5 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CFAP221Q4G0U5 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CFAP221Q4G0U5 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CFAP221Q4G0U5 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CFAP221Q4G0U5 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CFAP221Q4G0U5 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CFAP221Q4G0U5 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CFAP221Q4G0U5 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CFAP221Q4G0U5 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CFAP221Q4G0U5 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CFAP221Q4G0U5 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CFAP221Q4G0U5 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CFAP221Q4G0U5 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CFAP221Q4G0U5 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CFAP221Q4G0U5 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CFAP221Q4G0U5 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CFAP221Q4G0U5 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CFAP221Q4G0U5 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CFAP221Q4G0U5 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CFAP221Q4G0U5 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CFAP221Q4G0U5 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CFAP221Q4G0U5 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CFAP221Q4G0U5 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CFAP221Q4G0U5 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CFAP221Q4G0U5 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CFAP221Q4G0U5 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CFAP221Q4G0U5 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms