Protein–RNA interactions for Protein: Q496Y0

LONRF3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LONRF3Q496Y0 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LONRF3Q496Y0 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LONRF3Q496Y0 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LONRF3Q496Y0 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LONRF3Q496Y0 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LONRF3Q496Y0 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LONRF3Q496Y0 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LONRF3Q496Y0 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LONRF3Q496Y0 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
LONRF3Q496Y0 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LONRF3Q496Y0 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LONRF3Q496Y0 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LONRF3Q496Y0 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LONRF3Q496Y0 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LONRF3Q496Y0 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LONRF3Q496Y0 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
LONRF3Q496Y0 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LONRF3Q496Y0 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
LONRF3Q496Y0 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LONRF3Q496Y0 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LONRF3Q496Y0 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LONRF3Q496Y0 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LONRF3Q496Y0 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LONRF3Q496Y0 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LONRF3Q496Y0 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LONRF3Q496Y0 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LONRF3Q496Y0 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LONRF3Q496Y0 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LONRF3Q496Y0 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LONRF3Q496Y0 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LONRF3Q496Y0 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LONRF3Q496Y0 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LONRF3Q496Y0 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LONRF3Q496Y0 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LONRF3Q496Y0 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LONRF3Q496Y0 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LONRF3Q496Y0 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LONRF3Q496Y0 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LONRF3Q496Y0 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LONRF3Q496Y0 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LONRF3Q496Y0 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LONRF3Q496Y0 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LONRF3Q496Y0 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LONRF3Q496Y0 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
LONRF3Q496Y0 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LONRF3Q496Y0 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LONRF3Q496Y0 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LONRF3Q496Y0 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LONRF3Q496Y0 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LONRF3Q496Y0 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LONRF3Q496Y0 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LONRF3Q496Y0 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LONRF3Q496Y0 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LONRF3Q496Y0 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LONRF3Q496Y0 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LONRF3Q496Y0 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LONRF3Q496Y0 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LONRF3Q496Y0 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LONRF3Q496Y0 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LONRF3Q496Y0 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LONRF3Q496Y0 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LONRF3Q496Y0 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LONRF3Q496Y0 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LONRF3Q496Y0 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LONRF3Q496Y0 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LONRF3Q496Y0 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LONRF3Q496Y0 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LONRF3Q496Y0 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LONRF3Q496Y0 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LONRF3Q496Y0 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LONRF3Q496Y0 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LONRF3Q496Y0 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LONRF3Q496Y0 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LONRF3Q496Y0 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LONRF3Q496Y0 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LONRF3Q496Y0 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
LONRF3Q496Y0 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LONRF3Q496Y0 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LONRF3Q496Y0 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
LONRF3Q496Y0 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LONRF3Q496Y0 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LONRF3Q496Y0 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LONRF3Q496Y0 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LONRF3Q496Y0 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LONRF3Q496Y0 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LONRF3Q496Y0 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LONRF3Q496Y0 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LONRF3Q496Y0 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LONRF3Q496Y0 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LONRF3Q496Y0 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LONRF3Q496Y0 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LONRF3Q496Y0 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LONRF3Q496Y0 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LONRF3Q496Y0 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LONRF3Q496Y0 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LONRF3Q496Y0 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LONRF3Q496Y0 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LONRF3Q496Y0 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LONRF3Q496Y0 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LONRF3Q496Y0 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms