Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TTLL9Q3SXZ7 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TTLL9Q3SXZ7 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TTLL9Q3SXZ7 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TTLL9Q3SXZ7 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
TTLL9Q3SXZ7 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TTLL9Q3SXZ7 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TTLL9Q3SXZ7 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TTLL9Q3SXZ7 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
TTLL9Q3SXZ7 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TTLL9Q3SXZ7 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TTLL9Q3SXZ7 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TTLL9Q3SXZ7 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TTLL9Q3SXZ7 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TTLL9Q3SXZ7 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TTLL9Q3SXZ7 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TTLL9Q3SXZ7 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TTLL9Q3SXZ7 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TTLL9Q3SXZ7 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TTLL9Q3SXZ7 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TTLL9Q3SXZ7 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TTLL9Q3SXZ7 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TTLL9Q3SXZ7 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TTLL9Q3SXZ7 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TTLL9Q3SXZ7 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TTLL9Q3SXZ7 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TTLL9Q3SXZ7 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TTLL9Q3SXZ7 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TTLL9Q3SXZ7 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TTLL9Q3SXZ7 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TTLL9Q3SXZ7 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
TTLL9Q3SXZ7 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TTLL9Q3SXZ7 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TTLL9Q3SXZ7 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TTLL9Q3SXZ7 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TTLL9Q3SXZ7 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TTLL9Q3SXZ7 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TTLL9Q3SXZ7 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TTLL9Q3SXZ7 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TTLL9Q3SXZ7 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TTLL9Q3SXZ7 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TTLL9Q3SXZ7 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TTLL9Q3SXZ7 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TTLL9Q3SXZ7 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
TTLL9Q3SXZ7 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TTLL9Q3SXZ7 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TTLL9Q3SXZ7 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
TTLL9Q3SXZ7 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TTLL9Q3SXZ7 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TTLL9Q3SXZ7 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
TTLL9Q3SXZ7 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TTLL9Q3SXZ7 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TTLL9Q3SXZ7 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TTLL9Q3SXZ7 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TTLL9Q3SXZ7 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TTLL9Q3SXZ7 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TTLL9Q3SXZ7 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TTLL9Q3SXZ7 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TTLL9Q3SXZ7 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TTLL9Q3SXZ7 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TTLL9Q3SXZ7 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TTLL9Q3SXZ7 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TTLL9Q3SXZ7 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
TTLL9Q3SXZ7 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TTLL9Q3SXZ7 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TTLL9Q3SXZ7 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
TTLL9Q3SXZ7 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TTLL9Q3SXZ7 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TTLL9Q3SXZ7 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TTLL9Q3SXZ7 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TTLL9Q3SXZ7 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TTLL9Q3SXZ7 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TTLL9Q3SXZ7 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TTLL9Q3SXZ7 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TTLL9Q3SXZ7 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TTLL9Q3SXZ7 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TTLL9Q3SXZ7 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TTLL9Q3SXZ7 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TTLL9Q3SXZ7 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TTLL9Q3SXZ7 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TTLL9Q3SXZ7 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TTLL9Q3SXZ7 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TTLL9Q3SXZ7 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TTLL9Q3SXZ7 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TTLL9Q3SXZ7 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TTLL9Q3SXZ7 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TTLL9Q3SXZ7 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TTLL9Q3SXZ7 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TTLL9Q3SXZ7 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TTLL9Q3SXZ7 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TTLL9Q3SXZ7 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TTLL9Q3SXZ7 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TTLL9Q3SXZ7 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TTLL9Q3SXZ7 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TTLL9Q3SXZ7 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TTLL9Q3SXZ7 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TTLL9Q3SXZ7 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TTLL9Q3SXZ7 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TTLL9Q3SXZ7 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TTLL9Q3SXZ7 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms