Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI63

KRTAP20-1, Keratin-associated protein 20-1, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP20-1Q3LI63 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
KRTAP20-1Q3LI63 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
KRTAP20-1Q3LI63 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
KRTAP20-1Q3LI63 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
KRTAP20-1Q3LI63 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
KRTAP20-1Q3LI63 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
KRTAP20-1Q3LI63 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
KRTAP20-1Q3LI63 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
KRTAP20-1Q3LI63 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
KRTAP20-1Q3LI63 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
KRTAP20-1Q3LI63 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
KRTAP20-1Q3LI63 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
KRTAP20-1Q3LI63 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
KRTAP20-1Q3LI63 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
KRTAP20-1Q3LI63 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
KRTAP20-1Q3LI63 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
KRTAP20-1Q3LI63 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
KRTAP20-1Q3LI63 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
KRTAP20-1Q3LI63 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
KRTAP20-1Q3LI63 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
KRTAP20-1Q3LI63 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
KRTAP20-1Q3LI63 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
KRTAP20-1Q3LI63 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
KRTAP20-1Q3LI63 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC7.27□□□□□ -1.25
KRTAP20-1Q3LI63 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
KRTAP20-1Q3LI63 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
KRTAP20-1Q3LI63 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
KRTAP20-1Q3LI63 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
KRTAP20-1Q3LI63 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
KRTAP20-1Q3LI63 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
KRTAP20-1Q3LI63 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
KRTAP20-1Q3LI63 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
KRTAP20-1Q3LI63 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
KRTAP20-1Q3LI63 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
KRTAP20-1Q3LI63 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
KRTAP20-1Q3LI63 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
KRTAP20-1Q3LI63 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
KRTAP20-1Q3LI63 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
KRTAP20-1Q3LI63 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
KRTAP20-1Q3LI63 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
KRTAP20-1Q3LI63 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
KRTAP20-1Q3LI63 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
KRTAP20-1Q3LI63 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP20-1Q3LI63 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP20-1Q3LI63 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP20-1Q3LI63 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP20-1Q3LI63 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP20-1Q3LI63 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP20-1Q3LI63 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP20-1Q3LI63 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP20-1Q3LI63 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP20-1Q3LI63 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP20-1Q3LI63 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP20-1Q3LI63 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP20-1Q3LI63 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP20-1Q3LI63 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP20-1Q3LI63 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP20-1Q3LI63 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP20-1Q3LI63 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP20-1Q3LI63 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP20-1Q3LI63 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP20-1Q3LI63 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP20-1Q3LI63 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP20-1Q3LI63 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP20-1Q3LI63 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP20-1Q3LI63 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP20-1Q3LI63 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP20-1Q3LI63 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP20-1Q3LI63 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP20-1Q3LI63 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP20-1Q3LI63 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP20-1Q3LI63 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP20-1Q3LI63 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP20-1Q3LI63 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP20-1Q3LI63 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP20-1Q3LI63 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP20-1Q3LI63 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP20-1Q3LI63 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP20-1Q3LI63 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP20-1Q3LI63 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP20-1Q3LI63 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP20-1Q3LI63 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP20-1Q3LI63 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP20-1Q3LI63 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP20-1Q3LI63 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP20-1Q3LI63 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP20-1Q3LI63 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP20-1Q3LI63 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP20-1Q3LI63 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP20-1Q3LI63 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP20-1Q3LI63 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP20-1Q3LI63 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP20-1Q3LI63 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
KRTAP20-1Q3LI63 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
KRTAP20-1Q3LI63 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
KRTAP20-1Q3LI63 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
KRTAP20-1Q3LI63 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
KRTAP20-1Q3LI63 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
KRTAP20-1Q3LI63 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
KRTAP20-1Q3LI63 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms