Protein–RNA interactions for Protein: Q1XH10

SKIDA1, SKI/DACH domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 827 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIDA1Q1XH10 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SKIDA1Q1XH10 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SKIDA1Q1XH10 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SKIDA1Q1XH10 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SKIDA1Q1XH10 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SKIDA1Q1XH10 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SKIDA1Q1XH10 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SKIDA1Q1XH10 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SKIDA1Q1XH10 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SKIDA1Q1XH10 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SKIDA1Q1XH10 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SKIDA1Q1XH10 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SKIDA1Q1XH10 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SKIDA1Q1XH10 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SKIDA1Q1XH10 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SKIDA1Q1XH10 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SKIDA1Q1XH10 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SKIDA1Q1XH10 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SKIDA1Q1XH10 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SKIDA1Q1XH10 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SKIDA1Q1XH10 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SKIDA1Q1XH10 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SKIDA1Q1XH10 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SKIDA1Q1XH10 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SKIDA1Q1XH10 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SKIDA1Q1XH10 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SKIDA1Q1XH10 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SKIDA1Q1XH10 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SKIDA1Q1XH10 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SKIDA1Q1XH10 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SKIDA1Q1XH10 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SKIDA1Q1XH10 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SKIDA1Q1XH10 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SKIDA1Q1XH10 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SKIDA1Q1XH10 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SKIDA1Q1XH10 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SKIDA1Q1XH10 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SKIDA1Q1XH10 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SKIDA1Q1XH10 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SKIDA1Q1XH10 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SKIDA1Q1XH10 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SKIDA1Q1XH10 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SKIDA1Q1XH10 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SKIDA1Q1XH10 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SKIDA1Q1XH10 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SKIDA1Q1XH10 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SKIDA1Q1XH10 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
SKIDA1Q1XH10 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SKIDA1Q1XH10 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SKIDA1Q1XH10 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SKIDA1Q1XH10 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SKIDA1Q1XH10 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SKIDA1Q1XH10 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SKIDA1Q1XH10 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
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SKIDA1Q1XH10 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SKIDA1Q1XH10 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SKIDA1Q1XH10 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
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SKIDA1Q1XH10 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
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SKIDA1Q1XH10 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SKIDA1Q1XH10 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
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SKIDA1Q1XH10 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SKIDA1Q1XH10 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SKIDA1Q1XH10 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SKIDA1Q1XH10 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
SKIDA1Q1XH10 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SKIDA1Q1XH10 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SKIDA1Q1XH10 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SKIDA1Q1XH10 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
SKIDA1Q1XH10 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SKIDA1Q1XH10 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
SKIDA1Q1XH10 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
SKIDA1Q1XH10 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SKIDA1Q1XH10 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SKIDA1Q1XH10 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SKIDA1Q1XH10 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SKIDA1Q1XH10 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SKIDA1Q1XH10 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SKIDA1Q1XH10 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SKIDA1Q1XH10 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SKIDA1Q1XH10 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SKIDA1Q1XH10 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SKIDA1Q1XH10 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SKIDA1Q1XH10 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SKIDA1Q1XH10 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SKIDA1Q1XH10 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SKIDA1Q1XH10 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
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