Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM187BQ17R55 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM187BQ17R55 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM187BQ17R55 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM187BQ17R55 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM187BQ17R55 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM187BQ17R55 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM187BQ17R55 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM187BQ17R55 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM187BQ17R55 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM187BQ17R55 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM187BQ17R55 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM187BQ17R55 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM187BQ17R55 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM187BQ17R55 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM187BQ17R55 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM187BQ17R55 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM187BQ17R55 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM187BQ17R55 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM187BQ17R55 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM187BQ17R55 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM187BQ17R55 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM187BQ17R55 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM187BQ17R55 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM187BQ17R55 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM187BQ17R55 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM187BQ17R55 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM187BQ17R55 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM187BQ17R55 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM187BQ17R55 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM187BQ17R55 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM187BQ17R55 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM187BQ17R55 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM187BQ17R55 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM187BQ17R55 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM187BQ17R55 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM187BQ17R55 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM187BQ17R55 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM187BQ17R55 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM187BQ17R55 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM187BQ17R55 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM187BQ17R55 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM187BQ17R55 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM187BQ17R55 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM187BQ17R55 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM187BQ17R55 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM187BQ17R55 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM187BQ17R55 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM187BQ17R55 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM187BQ17R55 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM187BQ17R55 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM187BQ17R55 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM187BQ17R55 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM187BQ17R55 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM187BQ17R55 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM187BQ17R55 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM187BQ17R55 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM187BQ17R55 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
FAM187BQ17R55 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM187BQ17R55 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM187BQ17R55 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM187BQ17R55 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM187BQ17R55 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM187BQ17R55 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM187BQ17R55 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM187BQ17R55 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM187BQ17R55 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM187BQ17R55 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM187BQ17R55 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM187BQ17R55 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM187BQ17R55 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM187BQ17R55 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM187BQ17R55 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM187BQ17R55 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM187BQ17R55 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM187BQ17R55 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM187BQ17R55 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM187BQ17R55 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM187BQ17R55 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM187BQ17R55 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM187BQ17R55 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM187BQ17R55 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM187BQ17R55 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM187BQ17R55 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM187BQ17R55 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM187BQ17R55 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM187BQ17R55 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM187BQ17R55 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM187BQ17R55 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM187BQ17R55 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM187BQ17R55 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM187BQ17R55 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM187BQ17R55 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM187BQ17R55 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM187BQ17R55 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM187BQ17R55 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM187BQ17R55 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM187BQ17R55 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM187BQ17R55 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM187BQ17R55 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 189.6 ms