Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

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Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
FOXD1Q16676 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
FOXD1Q16676 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
FOXD1Q16676 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
FOXD1Q16676 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
FOXD1Q16676 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
FOXD1Q16676 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
FOXD1Q16676 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
FOXD1Q16676 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC29.19■■■□□ 2.26
FOXD1Q16676 TMF1P1-201ENST00000576058 373 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
FOXD1Q16676 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
FOXD1Q16676 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
FOXD1Q16676 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
FOXD1Q16676 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
FOXD1Q16676 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
FOXD1Q16676 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
FOXD1Q16676 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
FOXD1Q16676 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
FOXD1Q16676 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
FOXD1Q16676 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
FOXD1Q16676 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
FOXD1Q16676 APOH-201ENST00000205948 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
FOXD1Q16676 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
FOXD1Q16676 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
FOXD1Q16676 FO393415.3-201ENST00000456424 375 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
FOXD1Q16676 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
FOXD1Q16676 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
FOXD1Q16676 AC025165.5-201ENST00000602802 578 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
FOXD1Q16676 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
FOXD1Q16676 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
FOXD1Q16676 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
FOXD1Q16676 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
FOXD1Q16676 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
FOXD1Q16676 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
FOXD1Q16676 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
FOXD1Q16676 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
FOXD1Q16676 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
FOXD1Q16676 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
FOXD1Q16676 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
FOXD1Q16676 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
FOXD1Q16676 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
FOXD1Q16676 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
FOXD1Q16676 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
FOXD1Q16676 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
FOXD1Q16676 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
FOXD1Q16676 AC023200.1-201ENST00000519660 651 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
FOXD1Q16676 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
FOXD1Q16676 AC090503.2-201ENST00000551135 981 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
FOXD1Q16676 AL031058.1-201ENST00000561592 888 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
FOXD1Q16676 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC29.17■■■□□ 2.26
FOXD1Q16676 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
FOXD1Q16676 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
FOXD1Q16676 AC068631.1-255ENST00000608173 588 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
FOXD1Q16676 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
FOXD1Q16676 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
FOXD1Q16676 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
FOXD1Q16676 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
FOXD1Q16676 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
FOXD1Q16676 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
FOXD1Q16676 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
FOXD1Q16676 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
FOXD1Q16676 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
FOXD1Q16676 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
FOXD1Q16676 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
FOXD1Q16676 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
FOXD1Q16676 MTND2P9-201ENST00000422293 931 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
FOXD1Q16676 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
FOXD1Q16676 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
FOXD1Q16676 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
FOXD1Q16676 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
FOXD1Q16676 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
FOXD1Q16676 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
FOXD1Q16676 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
FOXD1Q16676 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
FOXD1Q16676 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
FOXD1Q16676 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
FOXD1Q16676 PMCHL1-203ENST00000423301 697 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
FOXD1Q16676 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
FOXD1Q16676 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
FOXD1Q16676 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
FOXD1Q16676 AP001542.1-201ENST00000591314 200 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
FOXD1Q16676 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
FOXD1Q16676 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
FOXD1Q16676 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
FOXD1Q16676 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
FOXD1Q16676 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
FOXD1Q16676 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
FOXD1Q16676 AC010422.1-201ENST00000414548 543 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
FOXD1Q16676 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
FOXD1Q16676 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
FOXD1Q16676 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
FOXD1Q16676 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
FOXD1Q16676 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
FOXD1Q16676 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
FOXD1Q16676 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
FOXD1Q16676 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
FOXD1Q16676 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
FOXD1Q16676 REC114-201ENST00000331090 927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
FOXD1Q16676 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
FOXD1Q16676 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
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