Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTF1Q16619 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTF1Q16619 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTF1Q16619 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTF1Q16619 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTF1Q16619 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTF1Q16619 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTF1Q16619 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTF1Q16619 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTF1Q16619 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTF1Q16619 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTF1Q16619 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTF1Q16619 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTF1Q16619 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTF1Q16619 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTF1Q16619 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTF1Q16619 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTF1Q16619 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTF1Q16619 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTF1Q16619 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTF1Q16619 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTF1Q16619 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTF1Q16619 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTF1Q16619 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTF1Q16619 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTF1Q16619 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTF1Q16619 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTF1Q16619 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTF1Q16619 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTF1Q16619 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTF1Q16619 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTF1Q16619 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTF1Q16619 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTF1Q16619 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTF1Q16619 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTF1Q16619 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTF1Q16619 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTF1Q16619 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTF1Q16619 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTF1Q16619 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTF1Q16619 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTF1Q16619 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTF1Q16619 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTF1Q16619 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTF1Q16619 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTF1Q16619 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTF1Q16619 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTF1Q16619 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTF1Q16619 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTF1Q16619 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTF1Q16619 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTF1Q16619 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTF1Q16619 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTF1Q16619 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTF1Q16619 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTF1Q16619 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTF1Q16619 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTF1Q16619 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTF1Q16619 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTF1Q16619 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CTF1Q16619 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTF1Q16619 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTF1Q16619 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTF1Q16619 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CTF1Q16619 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTF1Q16619 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTF1Q16619 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTF1Q16619 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CTF1Q16619 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CTF1Q16619 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CTF1Q16619 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CTF1Q16619 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CTF1Q16619 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CTF1Q16619 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CTF1Q16619 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTF1Q16619 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTF1Q16619 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTF1Q16619 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTF1Q16619 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTF1Q16619 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTF1Q16619 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTF1Q16619 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTF1Q16619 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTF1Q16619 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTF1Q16619 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTF1Q16619 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTF1Q16619 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTF1Q16619 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTF1Q16619 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTF1Q16619 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTF1Q16619 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTF1Q16619 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTF1Q16619 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTF1Q16619 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTF1Q16619 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTF1Q16619 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTF1Q16619 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTF1Q16619 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTF1Q16619 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTF1Q16619 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
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