Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF239Q16600 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF239Q16600 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF239Q16600 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF239Q16600 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF239Q16600 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF239Q16600 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF239Q16600 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF239Q16600 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF239Q16600 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF239Q16600 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF239Q16600 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF239Q16600 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF239Q16600 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF239Q16600 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF239Q16600 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF239Q16600 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF239Q16600 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ZNF239Q16600 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ZNF239Q16600 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ZNF239Q16600 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ZNF239Q16600 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ZNF239Q16600 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ZNF239Q16600 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ZNF239Q16600 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ZNF239Q16600 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ZNF239Q16600 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ZNF239Q16600 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ZNF239Q16600 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF239Q16600 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF239Q16600 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF239Q16600 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF239Q16600 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF239Q16600 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF239Q16600 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF239Q16600 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF239Q16600 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF239Q16600 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF239Q16600 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF239Q16600 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF239Q16600 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF239Q16600 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF239Q16600 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF239Q16600 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF239Q16600 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF239Q16600 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF239Q16600 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF239Q16600 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF239Q16600 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF239Q16600 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF239Q16600 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF239Q16600 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF239Q16600 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF239Q16600 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF239Q16600 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF239Q16600 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF239Q16600 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF239Q16600 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF239Q16600 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF239Q16600 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF239Q16600 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF239Q16600 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF239Q16600 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF239Q16600 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF239Q16600 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF239Q16600 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF239Q16600 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF239Q16600 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF239Q16600 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF239Q16600 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF239Q16600 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF239Q16600 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF239Q16600 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF239Q16600 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF239Q16600 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF239Q16600 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF239Q16600 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF239Q16600 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF239Q16600 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF239Q16600 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF239Q16600 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF239Q16600 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF239Q16600 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF239Q16600 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF239Q16600 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF239Q16600 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF239Q16600 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF239Q16600 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF239Q16600 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF239Q16600 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF239Q16600 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF239Q16600 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF239Q16600 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF239Q16600 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF239Q16600 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF239Q16600 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF239Q16600 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF239Q16600 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF239Q16600 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF239Q16600 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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