Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SGCAQ16586 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SGCAQ16586 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SGCAQ16586 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SGCAQ16586 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SGCAQ16586 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SGCAQ16586 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SGCAQ16586 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SGCAQ16586 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SGCAQ16586 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SGCAQ16586 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SGCAQ16586 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SGCAQ16586 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SGCAQ16586 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SGCAQ16586 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SGCAQ16586 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SGCAQ16586 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SGCAQ16586 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SGCAQ16586 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SGCAQ16586 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SGCAQ16586 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SGCAQ16586 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SGCAQ16586 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SGCAQ16586 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SGCAQ16586 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SGCAQ16586 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SGCAQ16586 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SGCAQ16586 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SGCAQ16586 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SGCAQ16586 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SGCAQ16586 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SGCAQ16586 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SGCAQ16586 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SGCAQ16586 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SGCAQ16586 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SGCAQ16586 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SGCAQ16586 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SGCAQ16586 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SGCAQ16586 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SGCAQ16586 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SGCAQ16586 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SGCAQ16586 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SGCAQ16586 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SGCAQ16586 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SGCAQ16586 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SGCAQ16586 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SGCAQ16586 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SGCAQ16586 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SGCAQ16586 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SGCAQ16586 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SGCAQ16586 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SGCAQ16586 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SGCAQ16586 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SGCAQ16586 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SGCAQ16586 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SGCAQ16586 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SGCAQ16586 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SGCAQ16586 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SGCAQ16586 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SGCAQ16586 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SGCAQ16586 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SGCAQ16586 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SGCAQ16586 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SGCAQ16586 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SGCAQ16586 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SGCAQ16586 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SGCAQ16586 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SGCAQ16586 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SGCAQ16586 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SGCAQ16586 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SGCAQ16586 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SGCAQ16586 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SGCAQ16586 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SGCAQ16586 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SGCAQ16586 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SGCAQ16586 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SGCAQ16586 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SGCAQ16586 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SGCAQ16586 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SGCAQ16586 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SGCAQ16586 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SGCAQ16586 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SGCAQ16586 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SGCAQ16586 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SGCAQ16586 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SGCAQ16586 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SGCAQ16586 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SGCAQ16586 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SGCAQ16586 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SGCAQ16586 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SGCAQ16586 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SGCAQ16586 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SGCAQ16586 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SGCAQ16586 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SGCAQ16586 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SGCAQ16586 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SGCAQ16586 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SGCAQ16586 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SGCAQ16586 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SGCAQ16586 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms