Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CNGA3Q16281 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CNGA3Q16281 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CNGA3Q16281 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CNGA3Q16281 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CNGA3Q16281 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CNGA3Q16281 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CNGA3Q16281 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CNGA3Q16281 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CNGA3Q16281 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CNGA3Q16281 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CNGA3Q16281 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CNGA3Q16281 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CNGA3Q16281 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CNGA3Q16281 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CNGA3Q16281 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CNGA3Q16281 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CNGA3Q16281 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CNGA3Q16281 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CNGA3Q16281 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CNGA3Q16281 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CNGA3Q16281 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CNGA3Q16281 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CNGA3Q16281 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CNGA3Q16281 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CNGA3Q16281 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CNGA3Q16281 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CNGA3Q16281 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CNGA3Q16281 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CNGA3Q16281 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CNGA3Q16281 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CNGA3Q16281 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CNGA3Q16281 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CNGA3Q16281 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CNGA3Q16281 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CNGA3Q16281 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CNGA3Q16281 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CNGA3Q16281 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CNGA3Q16281 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CNGA3Q16281 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CNGA3Q16281 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CNGA3Q16281 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CNGA3Q16281 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CNGA3Q16281 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CNGA3Q16281 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CNGA3Q16281 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CNGA3Q16281 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CNGA3Q16281 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CNGA3Q16281 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CNGA3Q16281 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CNGA3Q16281 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CNGA3Q16281 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CNGA3Q16281 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CNGA3Q16281 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CNGA3Q16281 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CNGA3Q16281 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CNGA3Q16281 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CNGA3Q16281 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CNGA3Q16281 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CNGA3Q16281 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CNGA3Q16281 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CNGA3Q16281 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CNGA3Q16281 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CNGA3Q16281 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CNGA3Q16281 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CNGA3Q16281 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CNGA3Q16281 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNGA3Q16281 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNGA3Q16281 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNGA3Q16281 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNGA3Q16281 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNGA3Q16281 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CNGA3Q16281 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNGA3Q16281 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNGA3Q16281 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNGA3Q16281 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNGA3Q16281 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNGA3Q16281 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNGA3Q16281 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNGA3Q16281 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNGA3Q16281 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNGA3Q16281 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CNGA3Q16281 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNGA3Q16281 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNGA3Q16281 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNGA3Q16281 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNGA3Q16281 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNGA3Q16281 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNGA3Q16281 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNGA3Q16281 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNGA3Q16281 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNGA3Q16281 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNGA3Q16281 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNGA3Q16281 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNGA3Q16281 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNGA3Q16281 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNGA3Q16281 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNGA3Q16281 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNGA3Q16281 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CNGA3Q16281 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
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