Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

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Length 413 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
E2F4Q16254 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
E2F4Q16254 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
E2F4Q16254 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
E2F4Q16254 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
E2F4Q16254 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
E2F4Q16254 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
E2F4Q16254 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
E2F4Q16254 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
E2F4Q16254 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
E2F4Q16254 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
E2F4Q16254 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
E2F4Q16254 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
E2F4Q16254 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
E2F4Q16254 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
E2F4Q16254 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
E2F4Q16254 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
E2F4Q16254 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
E2F4Q16254 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
E2F4Q16254 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
E2F4Q16254 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
E2F4Q16254 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
E2F4Q16254 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
E2F4Q16254 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
E2F4Q16254 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
E2F4Q16254 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
E2F4Q16254 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
E2F4Q16254 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
E2F4Q16254 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
E2F4Q16254 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
E2F4Q16254 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
E2F4Q16254 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
E2F4Q16254 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
E2F4Q16254 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
E2F4Q16254 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
E2F4Q16254 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
E2F4Q16254 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
E2F4Q16254 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
E2F4Q16254 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
E2F4Q16254 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
E2F4Q16254 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
E2F4Q16254 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
E2F4Q16254 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
E2F4Q16254 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
E2F4Q16254 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
E2F4Q16254 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
E2F4Q16254 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
E2F4Q16254 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
E2F4Q16254 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
E2F4Q16254 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
E2F4Q16254 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
E2F4Q16254 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
E2F4Q16254 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
E2F4Q16254 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
E2F4Q16254 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
E2F4Q16254 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
E2F4Q16254 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
E2F4Q16254 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
E2F4Q16254 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
E2F4Q16254 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
E2F4Q16254 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
E2F4Q16254 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
E2F4Q16254 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
E2F4Q16254 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
E2F4Q16254 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
E2F4Q16254 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
E2F4Q16254 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
E2F4Q16254 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
E2F4Q16254 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
E2F4Q16254 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
E2F4Q16254 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
E2F4Q16254 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
E2F4Q16254 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
E2F4Q16254 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
E2F4Q16254 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
E2F4Q16254 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
E2F4Q16254 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
E2F4Q16254 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
E2F4Q16254 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
E2F4Q16254 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
E2F4Q16254 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
E2F4Q16254 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
E2F4Q16254 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
E2F4Q16254 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
E2F4Q16254 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
E2F4Q16254 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
E2F4Q16254 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
E2F4Q16254 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
E2F4Q16254 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
E2F4Q16254 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
E2F4Q16254 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
E2F4Q16254 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
E2F4Q16254 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
E2F4Q16254 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
E2F4Q16254 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
E2F4Q16254 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
E2F4Q16254 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
E2F4Q16254 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
E2F4Q16254 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
E2F4Q16254 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
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