Protein–RNA interactions for Protein: Q16134

ETFDH, Electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETFDHQ16134 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ETFDHQ16134 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ETFDHQ16134 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ETFDHQ16134 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ETFDHQ16134 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ETFDHQ16134 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ETFDHQ16134 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ETFDHQ16134 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ETFDHQ16134 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ETFDHQ16134 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ETFDHQ16134 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ETFDHQ16134 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ETFDHQ16134 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ETFDHQ16134 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ETFDHQ16134 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ETFDHQ16134 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ETFDHQ16134 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ETFDHQ16134 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ETFDHQ16134 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ETFDHQ16134 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ETFDHQ16134 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ETFDHQ16134 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ETFDHQ16134 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ETFDHQ16134 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ETFDHQ16134 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ETFDHQ16134 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ETFDHQ16134 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ETFDHQ16134 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ETFDHQ16134 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ETFDHQ16134 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ETFDHQ16134 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ETFDHQ16134 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ETFDHQ16134 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ETFDHQ16134 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ETFDHQ16134 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ETFDHQ16134 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ETFDHQ16134 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ETFDHQ16134 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ETFDHQ16134 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ETFDHQ16134 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ETFDHQ16134 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ETFDHQ16134 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ETFDHQ16134 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ETFDHQ16134 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ETFDHQ16134 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ETFDHQ16134 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ETFDHQ16134 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ETFDHQ16134 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ETFDHQ16134 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ETFDHQ16134 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ETFDHQ16134 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ETFDHQ16134 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ETFDHQ16134 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ETFDHQ16134 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ETFDHQ16134 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ETFDHQ16134 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ETFDHQ16134 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ETFDHQ16134 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ETFDHQ16134 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ETFDHQ16134 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ETFDHQ16134 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ETFDHQ16134 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ETFDHQ16134 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ETFDHQ16134 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ETFDHQ16134 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ETFDHQ16134 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ETFDHQ16134 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ETFDHQ16134 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ETFDHQ16134 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ETFDHQ16134 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ETFDHQ16134 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ETFDHQ16134 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ETFDHQ16134 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ETFDHQ16134 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ETFDHQ16134 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ETFDHQ16134 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ETFDHQ16134 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ETFDHQ16134 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ETFDHQ16134 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ETFDHQ16134 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ETFDHQ16134 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ETFDHQ16134 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ETFDHQ16134 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ETFDHQ16134 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ETFDHQ16134 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ETFDHQ16134 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ETFDHQ16134 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ETFDHQ16134 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ETFDHQ16134 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ETFDHQ16134 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ETFDHQ16134 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ETFDHQ16134 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ETFDHQ16134 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ETFDHQ16134 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ETFDHQ16134 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ETFDHQ16134 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ETFDHQ16134 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ETFDHQ16134 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ETFDHQ16134 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ETFDHQ16134 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms