Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZFHX3Q15911 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZFHX3Q15911 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZFHX3Q15911 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZFHX3Q15911 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZFHX3Q15911 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZFHX3Q15911 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZFHX3Q15911 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZFHX3Q15911 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZFHX3Q15911 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZFHX3Q15911 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ZFHX3Q15911 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZFHX3Q15911 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZFHX3Q15911 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZFHX3Q15911 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZFHX3Q15911 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZFHX3Q15911 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZFHX3Q15911 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZFHX3Q15911 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZFHX3Q15911 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZFHX3Q15911 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZFHX3Q15911 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZFHX3Q15911 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZFHX3Q15911 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZFHX3Q15911 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZFHX3Q15911 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZFHX3Q15911 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZFHX3Q15911 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZFHX3Q15911 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ZFHX3Q15911 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ZFHX3Q15911 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZFHX3Q15911 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZFHX3Q15911 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZFHX3Q15911 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZFHX3Q15911 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZFHX3Q15911 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZFHX3Q15911 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZFHX3Q15911 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZFHX3Q15911 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZFHX3Q15911 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZFHX3Q15911 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ZFHX3Q15911 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZFHX3Q15911 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZFHX3Q15911 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZFHX3Q15911 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZFHX3Q15911 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZFHX3Q15911 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZFHX3Q15911 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZFHX3Q15911 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZFHX3Q15911 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZFHX3Q15911 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZFHX3Q15911 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZFHX3Q15911 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZFHX3Q15911 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZFHX3Q15911 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZFHX3Q15911 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZFHX3Q15911 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZFHX3Q15911 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZFHX3Q15911 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZFHX3Q15911 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ZFHX3Q15911 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZFHX3Q15911 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZFHX3Q15911 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZFHX3Q15911 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZFHX3Q15911 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZFHX3Q15911 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZFHX3Q15911 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZFHX3Q15911 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ZFHX3Q15911 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZFHX3Q15911 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZFHX3Q15911 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZFHX3Q15911 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZFHX3Q15911 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZFHX3Q15911 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZFHX3Q15911 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZFHX3Q15911 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZFHX3Q15911 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZFHX3Q15911 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZFHX3Q15911 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZFHX3Q15911 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZFHX3Q15911 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZFHX3Q15911 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZFHX3Q15911 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZFHX3Q15911 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZFHX3Q15911 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZFHX3Q15911 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZFHX3Q15911 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZFHX3Q15911 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZFHX3Q15911 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ZFHX3Q15911 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZFHX3Q15911 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZFHX3Q15911 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZFHX3Q15911 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZFHX3Q15911 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZFHX3Q15911 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZFHX3Q15911 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZFHX3Q15911 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZFHX3Q15911 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ZFHX3Q15911 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZFHX3Q15911 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
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