Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
NCOA1Q15788 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
NCOA1Q15788 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
NCOA1Q15788 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
NCOA1Q15788 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
NCOA1Q15788 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
NCOA1Q15788 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
NCOA1Q15788 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
NCOA1Q15788 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
NCOA1Q15788 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
NCOA1Q15788 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
NCOA1Q15788 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
NCOA1Q15788 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
NCOA1Q15788 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
NCOA1Q15788 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
NCOA1Q15788 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
NCOA1Q15788 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
NCOA1Q15788 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
NCOA1Q15788 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
NCOA1Q15788 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
NCOA1Q15788 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
NCOA1Q15788 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
NCOA1Q15788 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
NCOA1Q15788 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC29.68■■■□□ 2.34
NCOA1Q15788 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
NCOA1Q15788 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
NCOA1Q15788 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
NCOA1Q15788 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
NCOA1Q15788 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
NCOA1Q15788 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
NCOA1Q15788 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
NCOA1Q15788 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
NCOA1Q15788 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
NCOA1Q15788 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
NCOA1Q15788 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
NCOA1Q15788 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
NCOA1Q15788 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
NCOA1Q15788 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
NCOA1Q15788 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
NCOA1Q15788 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
NCOA1Q15788 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
NCOA1Q15788 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
NCOA1Q15788 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
NCOA1Q15788 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
NCOA1Q15788 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
NCOA1Q15788 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
NCOA1Q15788 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC29.66■■■□□ 2.34
NCOA1Q15788 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
NCOA1Q15788 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC29.66■■■□□ 2.34
NCOA1Q15788 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
NCOA1Q15788 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
NCOA1Q15788 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
NCOA1Q15788 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
NCOA1Q15788 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
NCOA1Q15788 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
NCOA1Q15788 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
NCOA1Q15788 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
NCOA1Q15788 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
NCOA1Q15788 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
NCOA1Q15788 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
NCOA1Q15788 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
NCOA1Q15788 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
NCOA1Q15788 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
NCOA1Q15788 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
NCOA1Q15788 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
NCOA1Q15788 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
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NCOA1Q15788 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
NCOA1Q15788 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
NCOA1Q15788 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
NCOA1Q15788 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
NCOA1Q15788 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
NCOA1Q15788 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
NCOA1Q15788 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
NCOA1Q15788 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
NCOA1Q15788 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
NCOA1Q15788 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
NCOA1Q15788 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
NCOA1Q15788 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
NCOA1Q15788 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
NCOA1Q15788 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
NCOA1Q15788 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
NCOA1Q15788 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
NCOA1Q15788 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
NCOA1Q15788 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
NCOA1Q15788 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
NCOA1Q15788 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
NCOA1Q15788 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
NCOA1Q15788 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
NCOA1Q15788 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
NCOA1Q15788 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
NCOA1Q15788 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
NCOA1Q15788 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
NCOA1Q15788 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC29.64■■■□□ 2.33
NCOA1Q15788 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.33
NCOA1Q15788 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
NCOA1Q15788 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
NCOA1Q15788 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
NCOA1Q15788 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
NCOA1Q15788 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
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