Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SYCP1Q15431 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SYCP1Q15431 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYCP1Q15431 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYCP1Q15431 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYCP1Q15431 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SYCP1Q15431 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYCP1Q15431 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYCP1Q15431 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYCP1Q15431 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYCP1Q15431 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYCP1Q15431 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYCP1Q15431 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYCP1Q15431 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYCP1Q15431 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYCP1Q15431 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYCP1Q15431 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYCP1Q15431 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYCP1Q15431 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYCP1Q15431 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYCP1Q15431 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYCP1Q15431 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYCP1Q15431 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYCP1Q15431 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYCP1Q15431 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYCP1Q15431 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYCP1Q15431 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYCP1Q15431 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYCP1Q15431 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYCP1Q15431 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SYCP1Q15431 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYCP1Q15431 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYCP1Q15431 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYCP1Q15431 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYCP1Q15431 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYCP1Q15431 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYCP1Q15431 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYCP1Q15431 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYCP1Q15431 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SYCP1Q15431 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYCP1Q15431 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYCP1Q15431 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYCP1Q15431 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYCP1Q15431 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYCP1Q15431 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYCP1Q15431 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYCP1Q15431 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYCP1Q15431 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYCP1Q15431 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYCP1Q15431 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYCP1Q15431 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYCP1Q15431 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYCP1Q15431 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYCP1Q15431 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYCP1Q15431 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYCP1Q15431 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYCP1Q15431 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYCP1Q15431 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYCP1Q15431 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYCP1Q15431 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYCP1Q15431 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SYCP1Q15431 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYCP1Q15431 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYCP1Q15431 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYCP1Q15431 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SYCP1Q15431 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYCP1Q15431 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SYCP1Q15431 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SYCP1Q15431 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYCP1Q15431 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYCP1Q15431 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYCP1Q15431 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYCP1Q15431 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYCP1Q15431 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYCP1Q15431 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYCP1Q15431 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYCP1Q15431 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYCP1Q15431 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYCP1Q15431 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYCP1Q15431 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYCP1Q15431 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYCP1Q15431 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SYCP1Q15431 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYCP1Q15431 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYCP1Q15431 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYCP1Q15431 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYCP1Q15431 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYCP1Q15431 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYCP1Q15431 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYCP1Q15431 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYCP1Q15431 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYCP1Q15431 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYCP1Q15431 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYCP1Q15431 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYCP1Q15431 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYCP1Q15431 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYCP1Q15431 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYCP1Q15431 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYCP1Q15431 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYCP1Q15431 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms