Protein–RNA interactions for Protein: Q15399

TLR1, Toll-like receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR1Q15399 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TLR1Q15399 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TLR1Q15399 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TLR1Q15399 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TLR1Q15399 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TLR1Q15399 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TLR1Q15399 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TLR1Q15399 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TLR1Q15399 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TLR1Q15399 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TLR1Q15399 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TLR1Q15399 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TLR1Q15399 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TLR1Q15399 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TLR1Q15399 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TLR1Q15399 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TLR1Q15399 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TLR1Q15399 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TLR1Q15399 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TLR1Q15399 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TLR1Q15399 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TLR1Q15399 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TLR1Q15399 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TLR1Q15399 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TLR1Q15399 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TLR1Q15399 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TLR1Q15399 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TLR1Q15399 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TLR1Q15399 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TLR1Q15399 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TLR1Q15399 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TLR1Q15399 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TLR1Q15399 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TLR1Q15399 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TLR1Q15399 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TLR1Q15399 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TLR1Q15399 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
TLR1Q15399 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TLR1Q15399 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TLR1Q15399 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TLR1Q15399 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TLR1Q15399 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TLR1Q15399 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TLR1Q15399 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TLR1Q15399 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TLR1Q15399 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TLR1Q15399 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TLR1Q15399 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TLR1Q15399 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TLR1Q15399 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TLR1Q15399 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TLR1Q15399 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TLR1Q15399 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TLR1Q15399 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
TLR1Q15399 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TLR1Q15399 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TLR1Q15399 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TLR1Q15399 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TLR1Q15399 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TLR1Q15399 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TLR1Q15399 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TLR1Q15399 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TLR1Q15399 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TLR1Q15399 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TLR1Q15399 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TLR1Q15399 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TLR1Q15399 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TLR1Q15399 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TLR1Q15399 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TLR1Q15399 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TLR1Q15399 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TLR1Q15399 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TLR1Q15399 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TLR1Q15399 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TLR1Q15399 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TLR1Q15399 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TLR1Q15399 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TLR1Q15399 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TLR1Q15399 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TLR1Q15399 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TLR1Q15399 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TLR1Q15399 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TLR1Q15399 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TLR1Q15399 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TLR1Q15399 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TLR1Q15399 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TLR1Q15399 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TLR1Q15399 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TLR1Q15399 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TLR1Q15399 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TLR1Q15399 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TLR1Q15399 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TLR1Q15399 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TLR1Q15399 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TLR1Q15399 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TLR1Q15399 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TLR1Q15399 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TLR1Q15399 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TLR1Q15399 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TLR1Q15399 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms