Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PUM3Q15397 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PUM3Q15397 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PUM3Q15397 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PUM3Q15397 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PUM3Q15397 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PUM3Q15397 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PUM3Q15397 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PUM3Q15397 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PUM3Q15397 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PUM3Q15397 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PUM3Q15397 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PUM3Q15397 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PUM3Q15397 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PUM3Q15397 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PUM3Q15397 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PUM3Q15397 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PUM3Q15397 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PUM3Q15397 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PUM3Q15397 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PUM3Q15397 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PUM3Q15397 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PUM3Q15397 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PUM3Q15397 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PUM3Q15397 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PUM3Q15397 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PUM3Q15397 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PUM3Q15397 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PUM3Q15397 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PUM3Q15397 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PUM3Q15397 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PUM3Q15397 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PUM3Q15397 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PUM3Q15397 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PUM3Q15397 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PUM3Q15397 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PUM3Q15397 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PUM3Q15397 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PUM3Q15397 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PUM3Q15397 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PUM3Q15397 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PUM3Q15397 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PUM3Q15397 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PUM3Q15397 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PUM3Q15397 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PUM3Q15397 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PUM3Q15397 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PUM3Q15397 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PUM3Q15397 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PUM3Q15397 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PUM3Q15397 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PUM3Q15397 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PUM3Q15397 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PUM3Q15397 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PUM3Q15397 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PUM3Q15397 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PUM3Q15397 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PUM3Q15397 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PUM3Q15397 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PUM3Q15397 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PUM3Q15397 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
PUM3Q15397 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PUM3Q15397 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PUM3Q15397 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PUM3Q15397 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PUM3Q15397 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PUM3Q15397 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PUM3Q15397 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PUM3Q15397 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PUM3Q15397 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PUM3Q15397 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PUM3Q15397 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PUM3Q15397 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PUM3Q15397 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PUM3Q15397 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PUM3Q15397 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PUM3Q15397 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PUM3Q15397 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PUM3Q15397 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PUM3Q15397 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PUM3Q15397 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PUM3Q15397 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PUM3Q15397 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PUM3Q15397 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PUM3Q15397 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PUM3Q15397 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PUM3Q15397 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PUM3Q15397 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PUM3Q15397 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PUM3Q15397 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PUM3Q15397 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PUM3Q15397 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PUM3Q15397 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PUM3Q15397 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PUM3Q15397 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PUM3Q15397 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PUM3Q15397 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PUM3Q15397 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PUM3Q15397 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PUM3Q15397 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
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