Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPRRQ15256 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPRRQ15256 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPRRQ15256 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPRRQ15256 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPRRQ15256 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPRRQ15256 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPRRQ15256 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPRRQ15256 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPRRQ15256 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPRRQ15256 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPRRQ15256 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPRRQ15256 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPRRQ15256 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPRRQ15256 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPRRQ15256 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPRRQ15256 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPRRQ15256 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPRRQ15256 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPRRQ15256 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPRRQ15256 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPRRQ15256 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPRRQ15256 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPRRQ15256 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPRRQ15256 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPRRQ15256 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPRRQ15256 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPRRQ15256 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPRRQ15256 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPRRQ15256 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPRRQ15256 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRRQ15256 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRRQ15256 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRRQ15256 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRRQ15256 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRRQ15256 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRRQ15256 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRRQ15256 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRRQ15256 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRRQ15256 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRRQ15256 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRRQ15256 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRRQ15256 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRRQ15256 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRRQ15256 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRRQ15256 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRRQ15256 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRRQ15256 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRRQ15256 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRRQ15256 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRRQ15256 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRRQ15256 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRRQ15256 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRRQ15256 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRRQ15256 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRRQ15256 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRRQ15256 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRRQ15256 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRRQ15256 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRRQ15256 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRRQ15256 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRRQ15256 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRRQ15256 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRRQ15256 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRRQ15256 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRRQ15256 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRRQ15256 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRRQ15256 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRRQ15256 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRRQ15256 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRRQ15256 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRRQ15256 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRRQ15256 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRRQ15256 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRRQ15256 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRRQ15256 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRRQ15256 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRRQ15256 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRRQ15256 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRRQ15256 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRRQ15256 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRRQ15256 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRRQ15256 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRRQ15256 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRRQ15256 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRRQ15256 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRRQ15256 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRRQ15256 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRRQ15256 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRRQ15256 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRRQ15256 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRRQ15256 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRRQ15256 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRRQ15256 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRRQ15256 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRRQ15256 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRRQ15256 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRRQ15256 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRRQ15256 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRRQ15256 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms