Protein–RNA interactions for Protein: Q15154

PCM1, Pericentriolar material 1 protein, humanhuman

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Length 2,024 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCM1Q15154 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PCM1Q15154 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PCM1Q15154 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PCM1Q15154 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PCM1Q15154 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PCM1Q15154 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PCM1Q15154 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PCM1Q15154 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PCM1Q15154 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PCM1Q15154 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PCM1Q15154 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PCM1Q15154 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PCM1Q15154 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PCM1Q15154 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PCM1Q15154 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PCM1Q15154 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PCM1Q15154 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PCM1Q15154 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PCM1Q15154 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PCM1Q15154 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PCM1Q15154 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PCM1Q15154 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PCM1Q15154 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PCM1Q15154 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PCM1Q15154 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PCM1Q15154 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PCM1Q15154 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PCM1Q15154 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PCM1Q15154 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PCM1Q15154 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PCM1Q15154 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PCM1Q15154 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PCM1Q15154 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PCM1Q15154 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PCM1Q15154 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PCM1Q15154 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PCM1Q15154 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PCM1Q15154 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PCM1Q15154 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PCM1Q15154 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PCM1Q15154 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PCM1Q15154 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PCM1Q15154 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PCM1Q15154 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PCM1Q15154 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
PCM1Q15154 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
PCM1Q15154 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PCM1Q15154 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PCM1Q15154 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PCM1Q15154 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PCM1Q15154 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PCM1Q15154 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PCM1Q15154 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PCM1Q15154 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PCM1Q15154 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PCM1Q15154 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PCM1Q15154 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PCM1Q15154 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PCM1Q15154 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PCM1Q15154 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PCM1Q15154 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PCM1Q15154 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PCM1Q15154 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PCM1Q15154 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PCM1Q15154 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PCM1Q15154 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
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PCM1Q15154 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PCM1Q15154 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
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PCM1Q15154 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
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PCM1Q15154 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
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PCM1Q15154 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PCM1Q15154 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PCM1Q15154 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PCM1Q15154 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PCM1Q15154 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PCM1Q15154 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PCM1Q15154 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PCM1Q15154 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PCM1Q15154 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PCM1Q15154 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PCM1Q15154 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PCM1Q15154 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PCM1Q15154 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PCM1Q15154 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PCM1Q15154 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PCM1Q15154 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PCM1Q15154 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PCM1Q15154 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PCM1Q15154 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PCM1Q15154 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PCM1Q15154 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PCM1Q15154 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PCM1Q15154 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
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