Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PCOLCEQ15113 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PCOLCEQ15113 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PCOLCEQ15113 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PCOLCEQ15113 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PCOLCEQ15113 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PCOLCEQ15113 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PCOLCEQ15113 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PCOLCEQ15113 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PCOLCEQ15113 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PCOLCEQ15113 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PCOLCEQ15113 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PCOLCEQ15113 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PCOLCEQ15113 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PCOLCEQ15113 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PCOLCEQ15113 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PCOLCEQ15113 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PCOLCEQ15113 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PCOLCEQ15113 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PCOLCEQ15113 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PCOLCEQ15113 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PCOLCEQ15113 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PCOLCEQ15113 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PCOLCEQ15113 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PCOLCEQ15113 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PCOLCEQ15113 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PCOLCEQ15113 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PCOLCEQ15113 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PCOLCEQ15113 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PCOLCEQ15113 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PCOLCEQ15113 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PCOLCEQ15113 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PCOLCEQ15113 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PCOLCEQ15113 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PCOLCEQ15113 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCOLCEQ15113 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCOLCEQ15113 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCOLCEQ15113 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCOLCEQ15113 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCOLCEQ15113 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCOLCEQ15113 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCOLCEQ15113 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCOLCEQ15113 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCOLCEQ15113 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCOLCEQ15113 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCOLCEQ15113 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCOLCEQ15113 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCOLCEQ15113 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCOLCEQ15113 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCOLCEQ15113 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCOLCEQ15113 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PCOLCEQ15113 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCOLCEQ15113 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCOLCEQ15113 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PCOLCEQ15113 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PCOLCEQ15113 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PCOLCEQ15113 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PCOLCEQ15113 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PCOLCEQ15113 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PCOLCEQ15113 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PCOLCEQ15113 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PCOLCEQ15113 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PCOLCEQ15113 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PCOLCEQ15113 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PCOLCEQ15113 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PCOLCEQ15113 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PCOLCEQ15113 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PCOLCEQ15113 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PCOLCEQ15113 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PCOLCEQ15113 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PCOLCEQ15113 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PCOLCEQ15113 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PCOLCEQ15113 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PCOLCEQ15113 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PCOLCEQ15113 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PCOLCEQ15113 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PCOLCEQ15113 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PCOLCEQ15113 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PCOLCEQ15113 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PCOLCEQ15113 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PCOLCEQ15113 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PCOLCEQ15113 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PCOLCEQ15113 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PCOLCEQ15113 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PCOLCEQ15113 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PCOLCEQ15113 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PCOLCEQ15113 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PCOLCEQ15113 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PCOLCEQ15113 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PCOLCEQ15113 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PCOLCEQ15113 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PCOLCEQ15113 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PCOLCEQ15113 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PCOLCEQ15113 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PCOLCEQ15113 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PCOLCEQ15113 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PCOLCEQ15113 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PCOLCEQ15113 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PCOLCEQ15113 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PCOLCEQ15113 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms