Protein–RNA interactions for Protein: Q15054

POLD3, DNA polymerase delta subunit 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 466 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD3Q15054 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
POLD3Q15054 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
POLD3Q15054 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
POLD3Q15054 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
POLD3Q15054 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLD3Q15054 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLD3Q15054 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLD3Q15054 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLD3Q15054 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLD3Q15054 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
POLD3Q15054 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLD3Q15054 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLD3Q15054 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLD3Q15054 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLD3Q15054 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLD3Q15054 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLD3Q15054 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLD3Q15054 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLD3Q15054 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLD3Q15054 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLD3Q15054 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLD3Q15054 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLD3Q15054 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLD3Q15054 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLD3Q15054 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLD3Q15054 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLD3Q15054 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLD3Q15054 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLD3Q15054 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
POLD3Q15054 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
POLD3Q15054 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLD3Q15054 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLD3Q15054 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLD3Q15054 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLD3Q15054 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLD3Q15054 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLD3Q15054 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLD3Q15054 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLD3Q15054 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLD3Q15054 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLD3Q15054 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLD3Q15054 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLD3Q15054 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLD3Q15054 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLD3Q15054 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLD3Q15054 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLD3Q15054 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLD3Q15054 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLD3Q15054 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLD3Q15054 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLD3Q15054 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLD3Q15054 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLD3Q15054 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLD3Q15054 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLD3Q15054 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLD3Q15054 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
POLD3Q15054 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
POLD3Q15054 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLD3Q15054 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLD3Q15054 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLD3Q15054 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLD3Q15054 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
POLD3Q15054 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLD3Q15054 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLD3Q15054 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLD3Q15054 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLD3Q15054 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLD3Q15054 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLD3Q15054 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLD3Q15054 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLD3Q15054 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLD3Q15054 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLD3Q15054 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLD3Q15054 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLD3Q15054 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
POLD3Q15054 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
POLD3Q15054 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLD3Q15054 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLD3Q15054 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLD3Q15054 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLD3Q15054 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLD3Q15054 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLD3Q15054 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLD3Q15054 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLD3Q15054 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLD3Q15054 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLD3Q15054 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLD3Q15054 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLD3Q15054 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLD3Q15054 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
POLD3Q15054 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLD3Q15054 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLD3Q15054 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLD3Q15054 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLD3Q15054 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLD3Q15054 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLD3Q15054 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLD3Q15054 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
POLD3Q15054 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLD3Q15054 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
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