Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMCO1Q147U7 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMCO1Q147U7 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMCO1Q147U7 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMCO1Q147U7 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMCO1Q147U7 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SMCO1Q147U7 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SMCO1Q147U7 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SMCO1Q147U7 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SMCO1Q147U7 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SMCO1Q147U7 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SMCO1Q147U7 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SMCO1Q147U7 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SMCO1Q147U7 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMCO1Q147U7 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMCO1Q147U7 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMCO1Q147U7 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMCO1Q147U7 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMCO1Q147U7 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SMCO1Q147U7 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SMCO1Q147U7 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SMCO1Q147U7 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMCO1Q147U7 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMCO1Q147U7 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SMCO1Q147U7 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMCO1Q147U7 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMCO1Q147U7 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMCO1Q147U7 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMCO1Q147U7 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMCO1Q147U7 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMCO1Q147U7 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMCO1Q147U7 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMCO1Q147U7 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMCO1Q147U7 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMCO1Q147U7 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMCO1Q147U7 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMCO1Q147U7 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMCO1Q147U7 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMCO1Q147U7 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMCO1Q147U7 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMCO1Q147U7 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMCO1Q147U7 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMCO1Q147U7 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMCO1Q147U7 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMCO1Q147U7 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMCO1Q147U7 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMCO1Q147U7 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMCO1Q147U7 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMCO1Q147U7 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMCO1Q147U7 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMCO1Q147U7 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMCO1Q147U7 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMCO1Q147U7 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMCO1Q147U7 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMCO1Q147U7 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMCO1Q147U7 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMCO1Q147U7 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMCO1Q147U7 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMCO1Q147U7 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMCO1Q147U7 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMCO1Q147U7 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMCO1Q147U7 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMCO1Q147U7 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMCO1Q147U7 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMCO1Q147U7 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMCO1Q147U7 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMCO1Q147U7 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SMCO1Q147U7 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMCO1Q147U7 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMCO1Q147U7 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMCO1Q147U7 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMCO1Q147U7 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMCO1Q147U7 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMCO1Q147U7 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMCO1Q147U7 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMCO1Q147U7 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMCO1Q147U7 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMCO1Q147U7 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMCO1Q147U7 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMCO1Q147U7 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMCO1Q147U7 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMCO1Q147U7 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMCO1Q147U7 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMCO1Q147U7 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMCO1Q147U7 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMCO1Q147U7 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMCO1Q147U7 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMCO1Q147U7 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMCO1Q147U7 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMCO1Q147U7 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMCO1Q147U7 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SMCO1Q147U7 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMCO1Q147U7 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMCO1Q147U7 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMCO1Q147U7 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMCO1Q147U7 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMCO1Q147U7 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMCO1Q147U7 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMCO1Q147U7 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMCO1Q147U7 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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