Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

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Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SSPNQ14714 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SSPNQ14714 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SSPNQ14714 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SSPNQ14714 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SSPNQ14714 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SSPNQ14714 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SSPNQ14714 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SSPNQ14714 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SSPNQ14714 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SSPNQ14714 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SSPNQ14714 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SSPNQ14714 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SSPNQ14714 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SSPNQ14714 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SSPNQ14714 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SSPNQ14714 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SSPNQ14714 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SSPNQ14714 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SSPNQ14714 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SSPNQ14714 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SSPNQ14714 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SSPNQ14714 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SSPNQ14714 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SSPNQ14714 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SSPNQ14714 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SSPNQ14714 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SSPNQ14714 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SSPNQ14714 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SSPNQ14714 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SSPNQ14714 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SSPNQ14714 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SSPNQ14714 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SSPNQ14714 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SSPNQ14714 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SSPNQ14714 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SSPNQ14714 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SSPNQ14714 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SSPNQ14714 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SSPNQ14714 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SSPNQ14714 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SSPNQ14714 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SSPNQ14714 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SSPNQ14714 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SSPNQ14714 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SSPNQ14714 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SSPNQ14714 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SSPNQ14714 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SSPNQ14714 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SSPNQ14714 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SSPNQ14714 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SSPNQ14714 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SSPNQ14714 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SSPNQ14714 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SSPNQ14714 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SSPNQ14714 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SSPNQ14714 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SSPNQ14714 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SSPNQ14714 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SSPNQ14714 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SSPNQ14714 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SSPNQ14714 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SSPNQ14714 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SSPNQ14714 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSPNQ14714 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSPNQ14714 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSPNQ14714 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSPNQ14714 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSPNQ14714 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSPNQ14714 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSPNQ14714 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSPNQ14714 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSPNQ14714 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSPNQ14714 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSPNQ14714 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSPNQ14714 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSPNQ14714 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSPNQ14714 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SSPNQ14714 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSPNQ14714 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSPNQ14714 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSPNQ14714 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSPNQ14714 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSPNQ14714 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSPNQ14714 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSPNQ14714 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSPNQ14714 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSPNQ14714 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSPNQ14714 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSPNQ14714 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSPNQ14714 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSPNQ14714 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSPNQ14714 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSPNQ14714 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSPNQ14714 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSPNQ14714 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SSPNQ14714 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SSPNQ14714 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SSPNQ14714 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SSPNQ14714 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
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