Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMC1AQ14683 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMC1AQ14683 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMC1AQ14683 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMC1AQ14683 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMC1AQ14683 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMC1AQ14683 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMC1AQ14683 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMC1AQ14683 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMC1AQ14683 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMC1AQ14683 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMC1AQ14683 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SMC1AQ14683 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMC1AQ14683 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMC1AQ14683 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMC1AQ14683 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMC1AQ14683 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMC1AQ14683 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMC1AQ14683 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMC1AQ14683 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMC1AQ14683 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMC1AQ14683 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMC1AQ14683 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMC1AQ14683 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMC1AQ14683 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMC1AQ14683 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMC1AQ14683 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMC1AQ14683 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMC1AQ14683 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMC1AQ14683 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMC1AQ14683 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMC1AQ14683 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMC1AQ14683 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMC1AQ14683 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMC1AQ14683 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMC1AQ14683 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMC1AQ14683 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMC1AQ14683 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMC1AQ14683 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SMC1AQ14683 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMC1AQ14683 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMC1AQ14683 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMC1AQ14683 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMC1AQ14683 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SMC1AQ14683 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMC1AQ14683 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMC1AQ14683 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMC1AQ14683 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMC1AQ14683 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMC1AQ14683 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMC1AQ14683 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMC1AQ14683 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMC1AQ14683 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMC1AQ14683 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMC1AQ14683 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMC1AQ14683 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMC1AQ14683 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMC1AQ14683 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMC1AQ14683 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMC1AQ14683 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMC1AQ14683 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMC1AQ14683 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SMC1AQ14683 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMC1AQ14683 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SMC1AQ14683 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMC1AQ14683 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMC1AQ14683 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SMC1AQ14683 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMC1AQ14683 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMC1AQ14683 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMC1AQ14683 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMC1AQ14683 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMC1AQ14683 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMC1AQ14683 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMC1AQ14683 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMC1AQ14683 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMC1AQ14683 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMC1AQ14683 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMC1AQ14683 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMC1AQ14683 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMC1AQ14683 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMC1AQ14683 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMC1AQ14683 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMC1AQ14683 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMC1AQ14683 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMC1AQ14683 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMC1AQ14683 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMC1AQ14683 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMC1AQ14683 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMC1AQ14683 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMC1AQ14683 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMC1AQ14683 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMC1AQ14683 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMC1AQ14683 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMC1AQ14683 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMC1AQ14683 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMC1AQ14683 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMC1AQ14683 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMC1AQ14683 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMC1AQ14683 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
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