Protein–RNA interactions for Protein: Q14139

UBE4A, Ubiquitin conjugation factor E4 A, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4AQ14139 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
UBE4AQ14139 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBE4AQ14139 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBE4AQ14139 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBE4AQ14139 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBE4AQ14139 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBE4AQ14139 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
UBE4AQ14139 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBE4AQ14139 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBE4AQ14139 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBE4AQ14139 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBE4AQ14139 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBE4AQ14139 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBE4AQ14139 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBE4AQ14139 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBE4AQ14139 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBE4AQ14139 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
UBE4AQ14139 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBE4AQ14139 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
UBE4AQ14139 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBE4AQ14139 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBE4AQ14139 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBE4AQ14139 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBE4AQ14139 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBE4AQ14139 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBE4AQ14139 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
UBE4AQ14139 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
UBE4AQ14139 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
UBE4AQ14139 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
UBE4AQ14139 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
UBE4AQ14139 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
UBE4AQ14139 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
UBE4AQ14139 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
UBE4AQ14139 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
UBE4AQ14139 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
UBE4AQ14139 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
UBE4AQ14139 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
UBE4AQ14139 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
UBE4AQ14139 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
UBE4AQ14139 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBE4AQ14139 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBE4AQ14139 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBE4AQ14139 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBE4AQ14139 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
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UBE4AQ14139 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBE4AQ14139 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBE4AQ14139 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBE4AQ14139 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBE4AQ14139 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBE4AQ14139 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBE4AQ14139 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
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UBE4AQ14139 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBE4AQ14139 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
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UBE4AQ14139 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBE4AQ14139 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBE4AQ14139 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
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UBE4AQ14139 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
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UBE4AQ14139 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBE4AQ14139 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
UBE4AQ14139 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBE4AQ14139 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
UBE4AQ14139 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBE4AQ14139 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBE4AQ14139 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBE4AQ14139 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBE4AQ14139 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBE4AQ14139 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBE4AQ14139 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBE4AQ14139 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBE4AQ14139 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBE4AQ14139 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBE4AQ14139 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBE4AQ14139 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBE4AQ14139 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBE4AQ14139 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBE4AQ14139 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBE4AQ14139 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBE4AQ14139 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBE4AQ14139 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBE4AQ14139 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBE4AQ14139 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
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