Protein–RNA interactions for Protein: Q14135

VGLL4, Transcription cofactor vestigial-like protein 4, humanhuman

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Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL4Q14135 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VGLL4Q14135 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VGLL4Q14135 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VGLL4Q14135 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VGLL4Q14135 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VGLL4Q14135 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
VGLL4Q14135 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VGLL4Q14135 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VGLL4Q14135 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
VGLL4Q14135 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
VGLL4Q14135 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VGLL4Q14135 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VGLL4Q14135 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VGLL4Q14135 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VGLL4Q14135 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VGLL4Q14135 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VGLL4Q14135 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VGLL4Q14135 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VGLL4Q14135 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VGLL4Q14135 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VGLL4Q14135 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
VGLL4Q14135 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VGLL4Q14135 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VGLL4Q14135 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VGLL4Q14135 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VGLL4Q14135 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VGLL4Q14135 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VGLL4Q14135 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VGLL4Q14135 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VGLL4Q14135 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
VGLL4Q14135 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
VGLL4Q14135 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
VGLL4Q14135 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
VGLL4Q14135 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
VGLL4Q14135 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
VGLL4Q14135 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
VGLL4Q14135 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
VGLL4Q14135 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VGLL4Q14135 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VGLL4Q14135 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VGLL4Q14135 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VGLL4Q14135 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VGLL4Q14135 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VGLL4Q14135 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VGLL4Q14135 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VGLL4Q14135 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VGLL4Q14135 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VGLL4Q14135 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VGLL4Q14135 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VGLL4Q14135 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VGLL4Q14135 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VGLL4Q14135 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
VGLL4Q14135 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VGLL4Q14135 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VGLL4Q14135 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VGLL4Q14135 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VGLL4Q14135 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VGLL4Q14135 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VGLL4Q14135 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VGLL4Q14135 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VGLL4Q14135 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VGLL4Q14135 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VGLL4Q14135 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VGLL4Q14135 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
VGLL4Q14135 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VGLL4Q14135 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
VGLL4Q14135 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
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VGLL4Q14135 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VGLL4Q14135 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VGLL4Q14135 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VGLL4Q14135 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VGLL4Q14135 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
VGLL4Q14135 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VGLL4Q14135 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VGLL4Q14135 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VGLL4Q14135 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VGLL4Q14135 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VGLL4Q14135 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VGLL4Q14135 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VGLL4Q14135 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VGLL4Q14135 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VGLL4Q14135 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VGLL4Q14135 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
VGLL4Q14135 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VGLL4Q14135 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VGLL4Q14135 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VGLL4Q14135 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VGLL4Q14135 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VGLL4Q14135 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VGLL4Q14135 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VGLL4Q14135 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
VGLL4Q14135 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VGLL4Q14135 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VGLL4Q14135 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VGLL4Q14135 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VGLL4Q14135 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VGLL4Q14135 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VGLL4Q14135 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
VGLL4Q14135 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
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